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free and open access to biodiversity data

Colección de referencia de otolitos, Instituto de Ciencias del Mar-CSIC

Última versión Publicado por Institute of Marine Sciences (ICM-CSIC) en Nov 30, 2018 Institute of Marine Sciences (ICM-CSIC)

This collection is a catalogue of otolith stored in a database. The database is regularly updated and at present (06/17/2014) it contains a total of 4556 high resolution images corresponding to 1381 species and 216 families from the Mediterranean Sea, Antarctic Ocean (Weddell Sea, Ross Sea, Antarctic Peninsula), Atlantic Ocean (Argentina, Uruguay, South-western Islands, Gulf of Mexico, USA, Canada, Baltic Sea, North Sea, Ireland Sea, Cantabric Sea, Portugal, Madeira, Canary Islands, Morocco, Cabo Verde, Senegal, Gabon, Namibia), Indic Ocean (Madagascar, Tanzania, Red Sea, Iran) and Pacific (Australia, New Zealand, New Caledonia, Muroroa, Peru, Ecuador, Canada, Alaska). AFORO website offers an open online catalogue of otolith images and its associated shape analysis through pattern recognition techniques applying Fourier transform (FT), curvature space scale (CSS) and wavelet analysis (WT). This site also includes an Automatic Taxon Identification such allows to search and identify directly using query images of otholits. Recently, AFORO has incorporated 3D otoliths.

Registros

Los datos en este registros biológicos recurso han sido publicados como Archivo Darwin Core(DwC-A), el cual es un formato estándar para compartir datos de biodiversidad como un conjunto de una o más tablas de datos. La tabla de datos del core contiene 7,924 registros.

Este IPT archiva los datos, sirviendo así como repositorio de datos. Los datos y metadatos están disponibles para descargar en la sección de descargas. La tabla de versiones muestra otras versiones del recurso que se han hecho accesibles al público y permite el seguimiento de los cambios hechos al recurso en el tiempo.

Descargas

Descargue la última versión de los datos como un Archivo Darwin Core (DwC-A) o los metadatos como EML o RTF:

Datos como un archivo DwC-A descargar 7,924 registros en Inglés (323 KB) - Frecuencia de actualización: diario
Metadatos como un archivo EML descargar en Inglés (16 KB)
Metadatos como un archivo RTF descargar en Inglés (10 KB)

Versiones

La siguiente tabla muestra sólo las versiones publicadas del recurso que son de acceso público.

¿Cómo referenciar?

Los usuarios deben citar este trabajo de la siguiente manera:

Lombarte, A., Ò. Chic, V. Parisi-Baradad, R. Olivella, J. Piera & E. García-Ladona. 2006. A web-based environment from shape analysis of fish otoliths. The AFORO database. Scientia Marina 70: 147-152.

Derechos

Los usuarios deben respetar los siguientes derechos de uso:

El publicador y propietario de los derechos de este trabajo es Institute of Marine Sciences (ICM-CSIC). This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License.

Registro GBIF

Este recurso ha sido registrado en GBIF con el siguiente UUID: e95d0010-b3f1-11de-82f8-b8a03c50a862.  Institute of Marine Sciences (ICM-CSIC) publica este recurso, y está registrado en GBIF como un publicador de datos avalado por GBIF Spain.

Palabras Clave

otolith; otoliths; sagitta; fish otoliths; otolith shape; otolith database; automatic taxon identification; wavelet; Fourier; curvature space scale; 3D otoliths

Contactos

¿Quién creó el recurso?:

Òscar Chic Giménez
Vice-director
Institute of Marine Sciencies (ICM-CSIC) Passeig Marítim de la Barceloneta, 37-49 E-08003 Barcelona Barcelona ES +34 93 230 95 00
http://www.icm.csic.es/

¿Quién puede resolver dudas acerca del recurso?:

Amalia Manjabacas Soriano
Technician
Institute of Marine Sciencies (ICM-CSIC) Passeig Marítim de la Barceloneta, 37-49 E-08003 Barcelona Barcelona ES +34 93 230 95 00
http://www.icm.csic.es/

¿Quién documentó los metadatos?:

Antoni Lombarte Carrera
Researcher
Institute of Marine Sciencies (ICM-CSIC) Passeig Marítim de la Barceloneta, 37-49 E-08003 Barcelona Barcelona ES +34 93 230 95 00
http://www.icm.csic.es/

Cobertura Geográfica

Species and families from the Mediterranean Sea, Antarctic Ocean (Weddell Sea, Ross Sea, Antarctic Peninsula), Atlantic Ocean (Argentina, Uruguay, South-western Islands, Gulf of Mexico, USA, Canada, Baltic Sea, North Sea, Ireland Sea, Cantabric Sea, Portugal, Madeira, Canary Islands, Morocco, Cabo Verde, Senegal, Gabon, Namibia), Indic Ocean (Madagascar, Tanzania, Red Sea, Iran) and Pacific (Australia, New Zealand, New Caledonia, Muroroa, Peru, Ecuador, Canada, Alaska).

Coordenadas límite Latitud Mínima Longitud Mínima [-90, -180], Latitud Máxima Longitud Máxima [90, 180]

Cobertura Taxonómica

No hay descripción disponible

Reino  Animalia
Filo  Chordata
Orden  Acipenseriformes,  Albuliformes,  Anguilliformes,  Argentiniformes,  Atheriniformes,  Aulopiformes,  Batrachoidiformes,  Beloniformes,  Beryciformes,  Characiformes,  Clupeiformes,  Cypriniformes,  Cyprinodontiformes,  Elopiformes,  Gadiformes,  Gasterosteiformes,  Gasterostiformes,  Gonorynchiformes,  Lampridiformes,  Lophiiformes,  Mugiliformes,  Myctophiformes,  Ophidiiformes,  Osmeriformes,  Osteoglossiformes,  Perciformes,  Pleuronectiformes,  Polymixiiformes,  Salmoniformes,  Scorpaeniformes,  Siluriformes,  Stephanoberyciformes,  Stomiiformes,  Tetraodontiformes,  Zeiformes

Cobertura Temporal

Época de Existencia 1975

Datos del Proyecto

No hay descripción disponible

Título Project ION tools for the search, management and visualization of heterogenous data over Internet (Ref: MCyT - TIC2000-0376-p4-04)
Fuentes de Financiación Ministerio Ciencia y Tecnología (MCyT)
Descripción del Área de Estudio Otolith images and its associated shape analysis through pattern recognition techniques applying Fourier transform (FT), curvature space scale (CSS) and wavelet analysis (WT) are used in identification of stocks, populations and species as part of ecological, trophic , paleontological, archeological and fishery studies. This site also includes an Automatic Taxon Identification such allows to search and identify directly using query images of otholits.

Personas asociadas al proyecto:

Investigador Principal
Emili García Ladona

Datos de la Colección

Nombre de la Colección Colección de referencia de otolitos, Instituto de Ciencias del Mar-CSIC
Identificador de la Colección e95d0010-b3f1-11de-82f8-b8a03c50a862
Identificador de la Colección Parental Not applicable
Métodos de preservación de los ejemplares Ningún tratamiento

Metadatos Adicionales

Identificadores Alternativos e95d0010-b3f1-11de-82f8-b8a03c50a862
doi:10.15468/wdwxid
https://ipt.gbif.es/resource?r=aforo