Description
This collection is a catalogue of the otolith part of the CBMR (ICM-CSIC) and associated to the data base AFORO. The database is regularly updated and at present (2023) it contains a total of 7905 high resolution images corresponding to 2716 species from 274 families at the CBMR of the Institut de Ciències del Mar (ICM-CSIC) from worldwide, especially in Mediterranean, Canary Islands, Antarctic and Namibian waters. Also, AFORO shows images from diverse atlases of otoliths (Rivaton & Bourret 1999; Leopold, van Damme, Philippart & Winter 2001; Campana 2004; Tuset, Lombarte & Assis 2008; Lin & Chang 201; Sadighzadeh, Tuset, Dadpour, Otero-Ferrer, Lombarte 2012; Volpedo, Thompson & Avigliano 2017). AFORO website (http://aforo.cmima.csic.es/) offers an online open catalogue of otolith images and its associated shape analysis through pattern recognition techniques applying wavelet analysis (WT), elliptic Fourier analysis (EFA) and classical morphometries, including relationship with fish length. The website also includes an Automatic Taxon Identification that allows to search and identify directly using query images of otoliths. The data base also is associated with Fishbase and Osteobase datbases. More information about the catalogue is here: https://scientiamarina.revistas.csic.es/index.php/scientiamarina/article/view/192
Enregistrements de données
Les données de cette ressource occurrence ont été publiées sous forme d'une Archive Darwin Core (Darwin Core Archive ou DwC-A), le format standard pour partager des données de biodiversité en tant qu'ensemble d'un ou plusieurs tableurs de données. Le tableur de données du cœur de standard (core) contient 9 394 enregistrements.
Cet IPT archive les données et sert donc de dépôt de données. Les données et métadonnées de la ressource sont disponibles pour téléchargement dans la section téléchargements. Le tableau des versions liste les autres versions de chaque ressource rendues disponibles de façon publique et permet de tracer les modifications apportées à la ressource au fil du temps.
Versions
Le tableau ci-dessous n'affiche que les versions publiées de la ressource accessibles publiquement.
Comment citer
Les chercheurs doivent citer cette ressource comme suit:
Chic Ò, Manjabacas A, Guerrero E, Lombarte A (2023). Otoliths Reference Collection. CBMR-AFORO (ICM-CSIC). Version 1.11. Institut de Ciències del Mar (CSIC). Occurrence dataset. https://ipt.gbif.es/resource?r=aforo&v=1.11
Droits
Les chercheurs doivent respecter la déclaration de droits suivante:
L’éditeur et détenteur des droits de cette ressource est Institut de Ciències del Mar (CSIC). Ce travail est sous licence Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0.
Enregistrement GBIF
Cette ressource a été enregistrée sur le portail GBIF, et possède l'UUID GBIF suivante : e95d0010-b3f1-11de-82f8-b8a03c50a862. Institut de Ciències del Mar (CSIC) publie cette ressource, et est enregistré dans le GBIF comme éditeur de données avec l'approbation du GBIF Spain.
Mots-clé
Occurrence; otolith; otoliths; sagitta; fish otoliths; otolith shape; otolith database; automatic taxon identification; wavelet; Fourier; curvature space scale; 3D otoliths; marine
Contacts
- Créateur
- Data Science Lab Manager
- Passeig Marítim de la Barceloneta, 37-49
- +34 93 230 95 00
- Fournisseur Des Métadonnées ●
- Créateur ●
- Personne De Contact
- Technician
- Passeig Marítim de la Barceloneta, 37-49
- +34 93 230 95 00
- Fournisseur Des Métadonnées ●
- Créateur ●
- Personne De Contact
- Curator
- Passeig Marítim de la Barceloneta, 37.
- +34 93 230 95 00
- Fournisseur Des Métadonnées
- Researcher
- Passeig Marítim de la Barceloneta, 37-49
- +34 93 230 95 00
Couverture géographique
Species and families from the Mediterranean Sea, Antarctic Ocean (Weddell Sea, Ross Sea, Antarctic Peninsula), Atlantic Ocean (Argentina, Uruguay, South-western Islands, Gulf of Mexico, USA, Canada, Baltic Sea, North Sea, Ireland Sea, Cantabric Sea, Portugal, Madeira, Canary Islands, Morocco, Cabo Verde, Senegal, Gabon, Namibia), Indic Ocean (Madagascar, Tanzania, Red Sea, Iran) and Pacific (Australia, New Zealand, New Caledonia, Muroroa, Peru, Ecuador, Canada, Alaska).
| Enveloppe géographique | Sud Ouest [-90, -180], Nord Est [90, 180] |
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Couverture taxonomique
Pas de description disponible
| Kingdom | Animalia |
|---|---|
| Phylum | Chordata |
| Order | Acipenseriformes, Albuliformes, Anguilliformes, Argentiniformes, Atheriniformes, Aulopiformes, Batrachoidiformes, Beloniformes, Beryciformes, Characiformes, Clupeiformes, Cypriniformes, Cyprinodontiformes, Elopiformes, Gadiformes, Gasterosteiformes, Gasterostiformes, Gonorynchiformes, Lampridiformes, Lophiiformes, Mugiliformes, Myctophiformes, Ophidiiformes, Osmeriformes, Osteoglossiformes, Perciformes, Pleuronectiformes, Polymixiiformes, Salmoniformes, Scorpaeniformes, Siluriformes, Stephanoberyciformes, Stomiiformes, Tetraodontiformes, Zeiformes |
Couverture temporelle
| Epoque de vie | 1975 |
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Données sur le projet
Pas de description disponible
| Titre | Project ION tools for the search, management and visualization of heterogenous data over Internet (Ref: MCyT - TIC2000-0376-p4-04) |
|---|---|
| Financement | Ministerio Ciencia y Tecnología (MCyT) |
| Description du domaine d'étude / de recherche | Otolith images and its associated shape analysis through pattern recognition techniques applying Fourier transform (FT), curvature space scale (CSS) and wavelet analysis (WT) are used in identification of stocks, populations and species as part of ecological, trophic , paleontological, archeological and fishery studies. This site also includes an Automatic Taxon Identification such allows to search and identify directly using query images of otholits. |
Les personnes impliquées dans le projet:
- Chercheur Principal
Données de collection
| Nom de la collection | CBMR-AFORO |
|---|---|
| Identifiant de collection | e95d0010-b3f1-11de-82f8-b8a03c50a862 |
| Identifiant de la collection parente | Not applicable |
| Méthode de conservation des spécimens | No treatment |
|---|
Métadonnées additionnelles
| Identifiants alternatifs | e95d0010-b3f1-11de-82f8-b8a03c50a862 |
|---|---|
| doi:10.15468/wdwxid | |
| https://ipt.gbif.es/resource?r=aforo |