Otoliths Reference Collection. CBMR-AFORO (ICM-CSIC)

Ocorrência
Versão mais recente published by Institut de Ciències del Mar (CSIC) on abr 24, 2023 Institut de Ciències del Mar (CSIC)
Publication date:
24 de abril de 2023
Licença:
CC-BY-NC 4.0

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Descrição

This collection is a catalogue of the otolith part of the CBMR (ICM-CSIC) and associated to the data base AFORO. The database is regularly updated and at present (2023) it contains a total of 7905 high resolution images corresponding to 2716 species from 274 families at the CBMR of the Institut de Ciències del Mar (ICM-CSIC) from worldwide, especially in Mediterranean, Canary Islands, Antarctic and Namibian waters. Also, AFORO shows images from diverse atlases of otoliths (Rivaton & Bourret 1999; Leopold, van Damme, Philippart & Winter 2001; Campana 2004; Tuset, Lombarte & Assis 2008; Lin & Chang 201; Sadighzadeh, Tuset, Dadpour, Otero-Ferrer, Lombarte 2012; Volpedo, Thompson & Avigliano 2017). AFORO website (http://aforo.cmima.csic.es/) offers an online open catalogue of otolith images and its associated shape analysis through pattern recognition techniques applying wavelet analysis (WT), elliptic Fourier analysis (EFA) and classical morphometries, including relationship with fish length. The website also includes an Automatic Taxon Identification that allows to search and identify directly using query images of otoliths. The data base also is associated with Fishbase and Osteobase datbases. More information about the catalogue is here: https://scientiamarina.revistas.csic.es/index.php/scientiamarina/article/view/192

Registros de Dados

Os dados deste recurso de ocorrência foram publicados como um Darwin Core Archive (DwC-A), que é o formato padronizado para compartilhamento de dados de biodiversidade como um conjunto de uma ou mais tabelas de dados. A tabela de dados do núcleo contém 9.394 registros.

This IPT archives the data and thus serves as the data repository. The data and resource metadata are available for download in the downloads section. The versions table lists other versions of the resource that have been made publicly available and allows tracking changes made to the resource over time.

Versões

A tabela abaixo mostra apenas versões de recursos que são publicamente acessíveis.

Como citar

Pesquisadores deveriam citar esta obra da seguinte maneira:

Chic Ò, Manjabacas A, Guerrero E, Lombarte A (2023). Otoliths Reference Collection. CBMR-AFORO (ICM-CSIC). Version 1.11. Institut de Ciències del Mar (CSIC). Occurrence dataset. https://ipt.gbif.es/resource?r=aforo&v=1.11

Direitos

Pesquisadores devem respeitar a seguinte declaração de direitos:

O editor e o detentor dos direitos deste trabalho é Institut de Ciències del Mar (CSIC). This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC 4.0) License.

GBIF Registration

Este recurso foi registrado no GBIF e atribuído ao seguinte GBIF UUID: e95d0010-b3f1-11de-82f8-b8a03c50a862.  Institut de Ciències del Mar (CSIC) publica este recurso, e está registrado no GBIF como um publicador de dados aprovado por GBIF Spain.

Palavras-chave

Occurrence; otolith; otoliths; sagitta; fish otoliths; otolith shape; otolith database; automatic taxon identification; wavelet; Fourier; curvature space scale; 3D otoliths; marine

Contatos

Òscar Chic
  • Originador
Data Science Lab Manager
Institut de Ciències del Mar (ICM-CSIC)
Passeig Marítim de la Barceloneta, 37-49
E-08003 Barcelona
Barcelona
ES
+34 93 230 95 00
Amalia Manjabacas
  • Provedor Dos Metadados
  • Originador
  • Ponto De Contato
Technician
Institut de Ciències del Mar (ICM-CSIC)
Passeig Marítim de la Barceloneta, 37-49
E-08003 Barcelona
Barcelona
ES
+34 93 230 95 00
Elena Guerrero
  • Provedor Dos Metadados
  • Originador
  • Ponto De Contato
Curator
Institut de Ciències del Mar (ICM-CSIC)
Passeig Marítim de la Barceloneta, 37.
E-08003 Barcelona
Barcelona
ES
+34 93 230 95 00
Antoni Lombarte
  • Provedor Dos Metadados
Researcher
Institut de Ciències del Mar (ICM-CSIC)
Passeig Marítim de la Barceloneta, 37-49
E-08003 Barcelona
Barcelona
ES
+34 93 230 95 00

Cobertura Geográfica

Species and families from the Mediterranean Sea, Antarctic Ocean (Weddell Sea, Ross Sea, Antarctic Peninsula), Atlantic Ocean (Argentina, Uruguay, South-western Islands, Gulf of Mexico, USA, Canada, Baltic Sea, North Sea, Ireland Sea, Cantabric Sea, Portugal, Madeira, Canary Islands, Morocco, Cabo Verde, Senegal, Gabon, Namibia), Indic Ocean (Madagascar, Tanzania, Red Sea, Iran) and Pacific (Australia, New Zealand, New Caledonia, Muroroa, Peru, Ecuador, Canada, Alaska).

Coordenadas delimitadoras Sul Oeste [-90, -180], Norte Leste [90, 180]

Cobertura Taxonômica

Nenhuma descrição disponível

Reino Animalia
Filo Chordata
Ordem Acipenseriformes, Albuliformes, Anguilliformes, Argentiniformes, Atheriniformes, Aulopiformes, Batrachoidiformes, Beloniformes, Beryciformes, Characiformes, Clupeiformes, Cypriniformes, Cyprinodontiformes, Elopiformes, Gadiformes, Gasterosteiformes, Gasterostiformes, Gonorynchiformes, Lampridiformes, Lophiiformes, Mugiliformes, Myctophiformes, Ophidiiformes, Osmeriformes, Osteoglossiformes, Perciformes, Pleuronectiformes, Polymixiiformes, Salmoniformes, Scorpaeniformes, Siluriformes, Stephanoberyciformes, Stomiiformes, Tetraodontiformes, Zeiformes

Cobertura Temporal

Período de tempo em que viveu 1975

Dados Sobre o Projeto

Nenhuma descrição disponível

Título Project ION tools for the search, management and visualization of heterogenous data over Internet (Ref: MCyT - TIC2000-0376-p4-04)
Financiamento Ministerio Ciencia y Tecnología (MCyT)
Descrição da Área de Estudo Otolith images and its associated shape analysis through pattern recognition techniques applying Fourier transform (FT), curvature space scale (CSS) and wavelet analysis (WT) are used in identification of stocks, populations and species as part of ecological, trophic , paleontological, archeological and fishery studies. This site also includes an Automatic Taxon Identification such allows to search and identify directly using query images of otholits.

O pessoal envolvido no projeto:

Emili García Ladona
  • Pesquisador Principal

Dados de Coleção

Nome da Coleção CBMR-AFORO
Identificador da Coleção e95d0010-b3f1-11de-82f8-b8a03c50a862
Identificador da Coleção Parental Not applicable
Métodos de preservação do espécime Sem tratamento

Metadados Adicionais

Identificadores alternativos e95d0010-b3f1-11de-82f8-b8a03c50a862
doi:10.15468/wdwxid
https://ipt.gbif.es/resource?r=aforo