Otoliths Reference Collection. CBMR-AFORO (ICM-CSIC)

Occurrence
Последняя версия опубликовано Institut de Ciències del Mar (CSIC) апр. 24, 2023 Institut de Ciències del Mar (CSIC)
Домой:
Ссылка
Дата публикации:
24 апреля 2023 г.
Опубликовано:
Institut de Ciències del Mar (CSIC)
Лицензия:
CC-BY-NC 4.0

Скачайте последнюю версию данных этого ресурса в формате Darwin Core Archive (DwC-A) или метаданных ресурса в форматах EML или RTF:

Данные в формате DwC-A Скачать 9 394 Записи в English (564 KB) - Частота обновления: as needed
Метаданные в формате EML Скачать в English (28 KB)
Метаданные в формате RTF Скачать в English (11 KB)

Описание

This collection is a catalogue of the otolith part of the CBMR (ICM-CSIC) and associated to the data base AFORO. The database is regularly updated and at present (2023) it contains a total of 7905 high resolution images corresponding to 2716 species from 274 families at the CBMR of the Institut de Ciències del Mar (ICM-CSIC) from worldwide, especially in Mediterranean, Canary Islands, Antarctic and Namibian waters. Also, AFORO shows images from diverse atlases of otoliths (Rivaton & Bourret 1999; Leopold, van Damme, Philippart & Winter 2001; Campana 2004; Tuset, Lombarte & Assis 2008; Lin & Chang 201; Sadighzadeh, Tuset, Dadpour, Otero-Ferrer, Lombarte 2012; Volpedo, Thompson & Avigliano 2017). AFORO website (http://aforo.cmima.csic.es/) offers an online open catalogue of otolith images and its associated shape analysis through pattern recognition techniques applying wavelet analysis (WT), elliptic Fourier analysis (EFA) and classical morphometries, including relationship with fish length. The website also includes an Automatic Taxon Identification that allows to search and identify directly using query images of otoliths. The data base also is associated with Fishbase and Osteobase datbases. More information about the catalogue is here: https://scientiamarina.revistas.csic.es/index.php/scientiamarina/article/view/192

Записи данных

Данные этого occurrence ресурса были опубликованы в виде Darwin Core Archive (DwC-A), который является стандартным форматом для обмена данными о биоразнообразии в виде набора из одной или нескольких таблиц. Основная таблица данных содержит 9 394 записей.

Данный экземпляр IPT архивирует данные и таким образом служит хранилищем данных. Данные и метаданные ресурсов доступны для скачивания в разделе Загрузки. В таблице версий перечислены другие версии ресурса, которые были доступны публично, что позволяет отслеживать изменения, внесенные в ресурс с течением времени.

Версии

В таблице ниже указаны только опубликованные версии ресурса, которые доступны для свободного скачивания.

Как оформить ссылку

Исследователи должны дать ссылку на эту работу следующим образом:

Chic Ò, Manjabacas A, Guerrero E, Lombarte A (2023). Otoliths Reference Collection. CBMR-AFORO (ICM-CSIC). Version 1.11. Institut de Ciències del Mar (CSIC). Occurrence dataset. https://ipt.gbif.es/resource?r=aforo&v=1.11

Права

Исследователи должны соблюдать следующие права:

Публикующей организацией и владельцем прав на данную работу является Institut de Ciències del Mar (CSIC). Эта работа находится под лицензией Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC 4.0).

Регистрация в GBIF

Этот ресурс был зарегистрирован в GBIF, ему был присвоен следующий UUID: e95d0010-b3f1-11de-82f8-b8a03c50a862.  Institut de Ciències del Mar (CSIC) отвечает за публикацию этого ресурса, и зарегистрирован в GBIF как издатель данных при оподдержке GBIF Spain.

Ключевые слова

Occurrence; otolith; otoliths; sagitta; fish otoliths; otolith shape; otolith database; automatic taxon identification; wavelet; Fourier; curvature space scale; 3D otoliths; marine

Контакты

Òscar Chic
  • Originator
Data Science Lab Manager
Institut de Ciències del Mar (ICM-CSIC)
Passeig Marítim de la Barceloneta, 37-49
E-08003 Barcelona
Barcelona
ES
+34 93 230 95 00
Amalia Manjabacas
  • Metadata Provider
  • Originator
  • Point Of Contact
Technician
Institut de Ciències del Mar (ICM-CSIC)
Passeig Marítim de la Barceloneta, 37-49
E-08003 Barcelona
Barcelona
ES
+34 93 230 95 00
Elena Guerrero
  • Metadata Provider
  • Originator
  • Point Of Contact
Curator
Institut de Ciències del Mar (ICM-CSIC)
Passeig Marítim de la Barceloneta, 37.
E-08003 Barcelona
Barcelona
ES
+34 93 230 95 00
Antoni Lombarte
  • Metadata Provider
Researcher
Institut de Ciències del Mar (ICM-CSIC)
Passeig Marítim de la Barceloneta, 37-49
E-08003 Barcelona
Barcelona
ES
+34 93 230 95 00

Географический охват

Species and families from the Mediterranean Sea, Antarctic Ocean (Weddell Sea, Ross Sea, Antarctic Peninsula), Atlantic Ocean (Argentina, Uruguay, South-western Islands, Gulf of Mexico, USA, Canada, Baltic Sea, North Sea, Ireland Sea, Cantabric Sea, Portugal, Madeira, Canary Islands, Morocco, Cabo Verde, Senegal, Gabon, Namibia), Indic Ocean (Madagascar, Tanzania, Red Sea, Iran) and Pacific (Australia, New Zealand, New Caledonia, Muroroa, Peru, Ecuador, Canada, Alaska).

Ограничивающие координаты Юг Запад [-90, -180], Север Восток [90, 180]

Таксономический охват

Описание отсутсвует

Kingdom Animalia
Phylum Chordata
Order Acipenseriformes, Albuliformes, Anguilliformes, Argentiniformes, Atheriniformes, Aulopiformes, Batrachoidiformes, Beloniformes, Beryciformes, Characiformes, Clupeiformes, Cypriniformes, Cyprinodontiformes, Elopiformes, Gadiformes, Gasterosteiformes, Gasterostiformes, Gonorynchiformes, Lampridiformes, Lophiiformes, Mugiliformes, Myctophiformes, Ophidiiformes, Osmeriformes, Osteoglossiformes, Perciformes, Pleuronectiformes, Polymixiiformes, Salmoniformes, Scorpaeniformes, Siluriformes, Stephanoberyciformes, Stomiiformes, Tetraodontiformes, Zeiformes

Временной охват

Период жизни 1975

Данные проекта

Описание отсутсвует

Название Project ION tools for the search, management and visualization of heterogenous data over Internet (Ref: MCyT - TIC2000-0376-p4-04)
Финансирование Ministerio Ciencia y Tecnología (MCyT)
Описание района исследования Otolith images and its associated shape analysis through pattern recognition techniques applying Fourier transform (FT), curvature space scale (CSS) and wavelet analysis (WT) are used in identification of stocks, populations and species as part of ecological, trophic , paleontological, archeological and fishery studies. This site also includes an Automatic Taxon Identification such allows to search and identify directly using query images of otholits.

Исполнители проекта:

Emili García Ladona
  • Principal Investigator

Данные коллекции

Название коллекции CBMR-AFORO
Идентификатор коллекции e95d0010-b3f1-11de-82f8-b8a03c50a862
Идентификатор родительской коллекции Not applicable
Методы сохранения образцов No treatment

Дополнительные метаданные

Альтернативные идентификаторы e95d0010-b3f1-11de-82f8-b8a03c50a862
doi:10.15468/wdwxid
https://ipt.gbif.es/resource?r=aforo