Описание
This collection is a catalogue of the otolith part of the CBMR (ICM-CSIC) and associated to the data base AFORO. The database is regularly updated and at present (2023) it contains a total of 7905 high resolution images corresponding to 2716 species from 274 families at the CBMR of the Institut de Ciències del Mar (ICM-CSIC) from worldwide, especially in Mediterranean, Canary Islands, Antarctic and Namibian waters. Also, AFORO shows images from diverse atlases of otoliths (Rivaton & Bourret 1999; Leopold, van Damme, Philippart & Winter 2001; Campana 2004; Tuset, Lombarte & Assis 2008; Lin & Chang 201; Sadighzadeh, Tuset, Dadpour, Otero-Ferrer, Lombarte 2012; Volpedo, Thompson & Avigliano 2017). AFORO website (http://aforo.cmima.csic.es/) offers an online open catalogue of otolith images and its associated shape analysis through pattern recognition techniques applying wavelet analysis (WT), elliptic Fourier analysis (EFA) and classical morphometries, including relationship with fish length. The website also includes an Automatic Taxon Identification that allows to search and identify directly using query images of otoliths. The data base also is associated with Fishbase and Osteobase datbases. More information about the catalogue is here: https://scientiamarina.revistas.csic.es/index.php/scientiamarina/article/view/192
Записи данных
Данные этого occurrence ресурса были опубликованы в виде Darwin Core Archive (DwC-A), который является стандартным форматом для обмена данными о биоразнообразии в виде набора из одной или нескольких таблиц. Основная таблица данных содержит 9 394 записей.
Данный экземпляр IPT архивирует данные и таким образом служит хранилищем данных. Данные и метаданные ресурсов доступны для скачивания в разделе Загрузки. В таблице версий перечислены другие версии ресурса, которые были доступны публично, что позволяет отслеживать изменения, внесенные в ресурс с течением времени.
Версии
В таблице ниже указаны только опубликованные версии ресурса, которые доступны для свободного скачивания.
Как оформить ссылку
Исследователи должны дать ссылку на эту работу следующим образом:
Chic Ò, Manjabacas A, Guerrero E, Lombarte A (2023). Otoliths Reference Collection. CBMR-AFORO (ICM-CSIC). Version 1.11. Institut de Ciències del Mar (CSIC). Occurrence dataset. https://ipt.gbif.es/resource?r=aforo&v=1.11
Права
Исследователи должны соблюдать следующие права:
Публикующей организацией и владельцем прав на данную работу является Institut de Ciències del Mar (CSIC). Эта работа находится под лицензией Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC 4.0).
Регистрация в GBIF
Этот ресурс был зарегистрирован в GBIF, ему был присвоен следующий UUID: e95d0010-b3f1-11de-82f8-b8a03c50a862. Institut de Ciències del Mar (CSIC) отвечает за публикацию этого ресурса, и зарегистрирован в GBIF как издатель данных при оподдержке GBIF Spain.
Ключевые слова
Occurrence; otolith; otoliths; sagitta; fish otoliths; otolith shape; otolith database; automatic taxon identification; wavelet; Fourier; curvature space scale; 3D otoliths; marine
Контакты
- Originator
- Data Science Lab Manager
- Passeig Marítim de la Barceloneta, 37-49
- +34 93 230 95 00
- Metadata Provider ●
- Originator ●
- Point Of Contact
- Technician
- Passeig Marítim de la Barceloneta, 37-49
- +34 93 230 95 00
- Metadata Provider ●
- Originator ●
- Point Of Contact
- Curator
- Passeig Marítim de la Barceloneta, 37.
- +34 93 230 95 00
- Metadata Provider
- Researcher
- Passeig Marítim de la Barceloneta, 37-49
- +34 93 230 95 00
Географический охват
Species and families from the Mediterranean Sea, Antarctic Ocean (Weddell Sea, Ross Sea, Antarctic Peninsula), Atlantic Ocean (Argentina, Uruguay, South-western Islands, Gulf of Mexico, USA, Canada, Baltic Sea, North Sea, Ireland Sea, Cantabric Sea, Portugal, Madeira, Canary Islands, Morocco, Cabo Verde, Senegal, Gabon, Namibia), Indic Ocean (Madagascar, Tanzania, Red Sea, Iran) and Pacific (Australia, New Zealand, New Caledonia, Muroroa, Peru, Ecuador, Canada, Alaska).
| Ограничивающие координаты | Юг Запад [-90, -180], Север Восток [90, 180] |
|---|
Таксономический охват
Описание отсутсвует
| Kingdom | Animalia |
|---|---|
| Phylum | Chordata |
| Order | Acipenseriformes, Albuliformes, Anguilliformes, Argentiniformes, Atheriniformes, Aulopiformes, Batrachoidiformes, Beloniformes, Beryciformes, Characiformes, Clupeiformes, Cypriniformes, Cyprinodontiformes, Elopiformes, Gadiformes, Gasterosteiformes, Gasterostiformes, Gonorynchiformes, Lampridiformes, Lophiiformes, Mugiliformes, Myctophiformes, Ophidiiformes, Osmeriformes, Osteoglossiformes, Perciformes, Pleuronectiformes, Polymixiiformes, Salmoniformes, Scorpaeniformes, Siluriformes, Stephanoberyciformes, Stomiiformes, Tetraodontiformes, Zeiformes |
Временной охват
| Период жизни | 1975 |
|---|
Данные проекта
Описание отсутсвует
| Название | Project ION tools for the search, management and visualization of heterogenous data over Internet (Ref: MCyT - TIC2000-0376-p4-04) |
|---|---|
| Финансирование | Ministerio Ciencia y Tecnología (MCyT) |
| Описание района исследования | Otolith images and its associated shape analysis through pattern recognition techniques applying Fourier transform (FT), curvature space scale (CSS) and wavelet analysis (WT) are used in identification of stocks, populations and species as part of ecological, trophic , paleontological, archeological and fishery studies. This site also includes an Automatic Taxon Identification such allows to search and identify directly using query images of otholits. |
Исполнители проекта:
- Principal Investigator
Данные коллекции
| Название коллекции | CBMR-AFORO |
|---|---|
| Идентификатор коллекции | e95d0010-b3f1-11de-82f8-b8a03c50a862 |
| Идентификатор родительской коллекции | Not applicable |
| Методы сохранения образцов | No treatment |
|---|
Дополнительные метаданные
| Альтернативные идентификаторы | e95d0010-b3f1-11de-82f8-b8a03c50a862 |
|---|---|
| doi:10.15468/wdwxid | |
| https://ipt.gbif.es/resource?r=aforo |