MGC Herbarium of University of Malaga (Spain): MGC-Algae dataset

最新バージョン University of Malaga によって公開 Nov 30, 2018 University of Malaga

La colección de algas del herbario MGC (MGC-Algae), es una de las más importantes de este tipo del mediterráneo occidental. La base de datos MGC-Algae tiene como objetivo la digitalización y publicación de los datos asociados con los más de 5.300 especímenes que se encuentran depositados en la colección, de los cuales el 95% está identificados a nivel de especie.Desde 2011, los Servicios Centrales de Investigación (SCAI) de la Universidad de Málaga son responsables de mantener el herbario y sus respectivas bases de datos.La colección está digitalizada a través del programa Herbar v3.7.1 (F. Pando et al. 1996-2011), estando la información de los especímenes accesibles a través de la red de GBIF (http://www.gbif.org/dataset/962e2f2e-f762-11e1-a439-00145eb45e9a).En la actualidad, la colección MGC-Algae contiene especímenes procedentes de 113 familias y 899 taxones, distribuidos en Rodófitas (54,6%), Feófitas (29,2%) and Clorófitas (15,8%). Por otro lado, las Cianófitas sólo representan el 0,4%.La mayoría de los pliegos proceden del Mediterráneo occidental, principalmente del sur de España (Andalucia= 54.5% de los especímenes), siento la provincia de Málaga la mejor representada con un 20.4%. Hay que destacar, especímenes procedentes de Marruecos (9,3%), Japón (5%) y de la Antártida (1,4%).La mayor incorporación de pliegos en la colección MGC-Algae se dio entre 1975 y 1996, años que reflejan la intensa actividad del Dr. Francisco Conde. Las recolecciones de los años 2007 y 2008 corresponden a proyectos encaminados a completar la flora ficológica de Andalucía.Además, la colección de algas del Herbario MGC alberga tres pequeñas colecciones catalogadas como históricas por su antigedad y origen. Un herbario de 198 ejemplares procedente de la Academia Malagueña de Ciencias donados en 1975 (Conde, 1992), otro donado por el Instituto de Investigaciones Pesqueras de Cádiz, compuesto por 80 pliegos, y finalmente una colección de 61 preparaciones microscópicas donado por el Laboratorio Oceanográfico de Málaga.El herbario MGC es uno de los herbarios de referencia para Flora Phycologica Iberica (Gómez-Garreta 2000-) La revista Acta Botanica Malacitana (B. Cabezudo 1975-) (http://www.biolveg.uma.es/abm/abm.html) está estrechamente relacionada con el herbario MGC y periodicamente publica artículos que están basados en datos incluidos en su colección. The MGC herbarium algae collection (MGC-Algae) is one the most important collections of this kind at Western Mediterranean Region. MGC-Algae dataset aims to digitize and publish data associated with over 5.300 specimens deposited in the collection, of which 95% of the specimens are identified at species level. Since 2011, the University of Malaga’s Central Research Service (SCAI) has been responsible for maintaining the herbarium and datasets. The collection is digitized by Herbar v3.7.1 software (F. Pando et al. 1996–2011), making specimens accessible through the GBIF network (http://www.gbif.org/dataset/962e2f2e-f762-11e1-a439-00145eb45e9a). At present, 113 families and 899 taxa, distributed in Rhodophyta (54.6%), Phaeophyta (29.2%) and Chlorophyta (15.8%), constitute the MGC-Algae collection, whereas, Cyanophyta make only up 0.4%. Most of the specimens are from the Western Mediterranean Region, mainly Southern Spain (Andalusia= 54.5% of specimens), Malaga province being the most important with 20.4%. It is worth highlighting specimens from Morocco (9.3%), Japan (5%) and Antarctica (1.4%).The higher sheet intake in this collection was since 1975 to 1996, main research period of PhD. Francisco Conde. Harvesting period from 2007 to 2008 is corresponded with projects for completing the Andalusian phycological flora.Moreover, this algae collection contain three little collections classified as historic collections due to their age and origin. An herbarium make up 198 sheets from Malaga Academy of Sciences given at 1975 (Conde, 1192), another one donated by Cadiz Fisheries Research Institute, constituted of 80 sheets and finally a collection of 61 microscopic slides given by Malaga Oceanographic Center.MGC herbarium is one of the reference herbaria for Flora Phycologica Iberica (Gómez-Garreta 2000-). The journal Acta Botanica Malacitana (B. Cabezudo 1975-) (http://www.biolveg.uma.es/abm/abm.html) is closely associated with the MGC Herbarium and periodically publishes papers that are based on data included in its dataset.

データ レコード

この オカレンス(観察データと標本) リソース内のデータは、1 つまたは複数のデータ テーブルとして生物多様性データを共有するための標準化された形式であるダーウィン コア アーカイブ (DwC-A) として公開されています。 コア データ テーブルには、5,316 レコードが含まれています。

この IPT はデータをアーカイブし、データ リポジトリとして機能します。データとリソースのメタデータは、 ダウンロード セクションからダウンロードできます。 バージョン テーブルから公開可能な他のバージョンを閲覧でき、リソースに加えられた変更を知ることができます。

ダウンロード

DwC-A形式のリソース データまたは EML / RTF 形式のリソース メタデータの最新バージョンをダウンロード:

DwC ファイルとしてのデータ ダウンロード 5,316 レコード Spanish で (237 KB) - 更新頻度: annually
EML ファイルとしてのメタデータ ダウンロード English で (25 KB)
RTF ファイルとしてのメタデータ ダウンロード English で (22 KB)

バージョン

次の表は、公にアクセス可能な公開バージョンのリソースのみ表示しています。

引用方法

研究者はこの研究内容を以下のように引用する必要があります。:

MGC Herbarium of University of Malaga (Spain): MGC-Algae dataset. University of Malaga. Dataset/Occurrence. http://www.gbif.es/ipt/resource?r=mgc-algae

権利

研究者は権利に関する下記ステートメントを尊重する必要があります。:

パブリッシャーとライセンス保持者権利者は University of Malaga。 This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License.

GBIF登録

このリソースをはGBIF と登録されており GBIF UUID: 962e2f2e-f762-11e1-a439-00145eb45e9aが割り当てられています。   GBIF Spain によって承認されたデータ パブリッシャーとして GBIF に登録されているUniversity of Malaga が、このリソースをパブリッシュしました。

キーワード

Malaga; Andalusia; Spain; Seagrass; SCAI; University of Malaga; MGC Herbarium; MGC; Plantae; Chromista; Bacteria; Clorophyta; Rhodophyta; Phaeophyta; Cyanophyta; Rhodomelaceae; Sargassaceae; Dictyotaceae; Corallinaceae; Ceramiaceae; Cystoseira; Codium; Ulva; Asparagopsis; Gelidium; Occurrence; Specimen

連絡先

リソースを作成した人:

Baltasar Cabezudo Artero
Scientific Manager
University of Málaga Departament of Plant Biology, (Botany Area). Faculty of Sciences, University of Málaga. Campus Teatinos s/n. 29071 Málaga Málaga ES +34 952131944
http://www.biolveg.uma.es

リソースに関する質問に答えることができる人:

José García Sánchez
Herbarium Curator
University of Málaga Servicios Centrales de Apoyo a la Investigación (SCAI). Bulevar Louis Pasteur, 33. Campus de Teatinos 29071 Málaga Málaga ES +34 952137414
http://www.scai.uma.es/servicios/ciencias_vida/herbario/herbario.html

メタデータを記載した人:

José García Sánchez
Herbarium Curator
University of Málaga Servicios Centrales de Apoyo a la Investigación (SCAI). Bulevar Louis Pasteur, 33. Campus de Teatinos 29071 Málaga Málaga ES +34 952137414
http://www.scai.uma.es/servicios/ciencias_vida/herbario/herbario.html

地理的範囲

NA

座標(緯度経度) 南 西 [33.498, -7.372], 北 東 [40.194, 11.127]

生物分類学的範囲

The 5.300 sheets of the MGC-Algae collection are grouped into 113 families, 333 genera, 840 species and 899 taxa (including infraspecific categories). Most of the specimens are red algae (Rhodophyta= 54.6%), followed by brown algae (Phaeophyta= 29.2%) and green algae (Chlorophyta= 15.8%). The main families in order of abundance are Rhodomelaceae (8.4%), Sargassaceae (7.3%), Dictyotaceae (7.1%), Corallinaceae (6.4%) and Ceramiaceae (5.0%).Main genera in order of abundance are Cystoseira (4.6%), Codium (3.7%), Ulva (3.6%), Asparagopsis (3.3%) and Gelidium (3.2%)

Kingdom  Plantae (plants),  Chromista (chromista),  Bacteria (bacteria)
Phylum  Clorophyta (green algae),  Rhodophyta (red algae),  Phaeophyta (brown algae),  Cyanophyta (blue-green algae)
Family  Rhodomelaceae,  Sargassaceae,  Dictyotaceae,  Corallinaceae,  Ceramiaceae
Genus  Cystoseira,  Codium,  Ulva,  Asparagopsis,  Gelidium

時間的範囲

開始日 / 終了日 1831-01-01 / 2014-01-01
生成(収集)期間 NA
生息期間 NA

プロジェクトデータ

説明がありません

タイトル Digitalización y Gestión de las Bases de Datos del Herbario MGC de la Universidad de Málaga
ファンデイング >>>> Scientific research project: "Informatización del Herbario de la Universidad de Málaga (MGC)". Reference: CLEG2004-21156-E Fund: Ministerio de Educación y Ciencia (Spain). Length: 2006 January - 2009 September. Principal researcher: Dr. Baltasar Cabezudo Artero. >>>>Scientific research project: "Realización de una prestación de servicios para el mantenimiento e inclusión de pliegos del proyecto Flora de Andalucía Oriental en el Herbario público de la Universidad de Málaga". Reference: 8.06/03.3353 Fund: Junta de Andalucía Length: 2010 February - 2011 February. Principal researcher: Dr. Baltasar Cabezudo Artero. >>>>Scientific research project: "Digitalización y Gestión de las Bases de Datos del Herbario MGC de la Universidad de Málaga". Reference: 8.06/03.3353 Fund: Ministerio de Ciencia e Innovación (Spain). Subprograma Personal Técnico de Apoyo Length: 2012 January - 2014 December. Principal responsible: Dr. José García Sánchez. >>>>Temporary staff for assistance in fieldworks, contracted through Junta de Andalucía (Spain) research group: Biodiversidad, Conservación y Recursos Vegetales; Group code: RNM-115.
Study Area Description NA
研究の意図、目的、背景など(デザイン) NA

プロジェクトに携わる要員:

研究代表者
Baltasar Cabezudo Artero

収集方法

The plants of this collection were mainly gathered by researchers of the Botany Area of the Department of Plant Biology at University of Malaga, as well as by members of the herbarium. A small component of the collection comes from exchanges or donations from other research centres or researchers.

Study Extent Most plants are from Southern Spain (Andalusia), Malaga province being the most widely represented area, the aim being to cover the widest degree of seaweed biodiversity for this territory. In addition, the collection contains seaweed from Northern Morocco and several places from the rest of Spain and countries from Europe and Africa.
Quality Control Every specimen of the MGC-Algae collection has been identified by researchers of the Botany Area of the Department of Plant Biology at University of Malaga. The dataset is analysed in search of digitalisation errors before uploading to the GBIF Portal. This check is carried out by the DarwinTest v3.2 tool (Ortega-Maqueda and Pando 2008), provided by the Spanish GBIF Node. This tool looks for mistakes in taxonomy, dates, geospatial information, collectors, identifiers, etc.

Method step description:

  1. Before incorporating new plants in the herbarium, the steps described below are followed. First, the material is pressed and dried, mounted on double A2 standard size (42 × 59.4 cm) sheets which perfectly cover and protect the specimen. Inside each sheet, an identification label provides the following information: taxonomy, country, province, county, locality, georeference, date, ecology, collectors and determinations. To kill any insects contained in the sheets, they are frozen at -20 °C for 72 hours. Periodically, the herbarium room is fumigated. The specimens are kept in compact shelving cabinets and alphabetically arranged by families, genera and species.

コレクションデータ

コレクション名 MGC-Algae
コレクション識別子 962e2f2e-f762-11e1-a439-00145eb45e9a
Parent Collection Identifier Not applicable
標本保存方法 Dried and pressed
Curatorialユニット カウント 5,316 +/- 0 Sheets ,  カウント 901 +/- 0 Taxons ,  カウント 487 +/- 0 Species ,  カウント 213 +/- 0 Genus ,  カウント 88 +/- 0 Families

書誌情報の引用

  1. PUBLICATIONS FROM THIS DATASET - García-Sánchez J, Cabezudo B (2014) El herbario MGC de la Universidad de Málaga. Boletín de la Asociación de Herbarios Ibero-Macaronésicos (AHIM) 16: 20-26.
  2. REFERENCES CITED WITHIN THE METADATA - Cabezudo B (Ed) (1975-2013) Acta Botanica Malacitana. (Periodicals). Vol. 1-37. ISSN 0210-9506. Electronic version ISSN 2340-5074. http://www.biolveg.uma.es/abm/abm.html - Gómez Garreta A (Coord.) (2000-). Flora phycologica iberica. Servicio de Publicaciones, Universidad de Murcia. - Ortega-Maqueda I, Pando F (2008) DARWIN_TEST v3.2: Una aplicación para la validación y el chequeo de los datos en formato Darwin Core 1.2 or Darwin Core 1.4, Unidad de Coordinación de GBIF. ES, CSIC. Ministerio de Educación y Ciencia. Madrid (Spain), http://www.gbif.es/Darwin_test/Darwin_test.php - Pando F et al. (1994-2010) HERBAR (3.7.1): A database application for herbarium management: http://www.gbif.es/herbar/herbar.php. Coordination Unit of GBIF. ES, CSIC. Ministry of Science and Innovation. Madrid, Spain.
  3. REFERENCES USED TO IDENTIFY DATASET SPECIMENS - Gómez-Garreta A (Coord.) (2000-). Flora phycologica iberica. Servicio de Publicaciones, Universidad de Murcia.
  4. SOME PUBLICATIONS BASED ON THIS DATASET - Altamirano M, Díaz-Such B, García-Sánchez J (2006) 161. Notas corológicas del macrofitobentos de Andalucía (España) VI Acta Botanica Malacitana 31: 172-174. - Altamirano M, López-Blanco E, Orriach R (2008) 175. Notas corológicas del macrofitobentos de Andalucía (España) VII Acta Botanica Malacitana 33: 329-332. - Arjona Fernández, María del Mar, Bañares España E, Flores-Moya A (2011) 208. Notas corológicas del macrofitobentos de Andalucía (España) X Acta Botanica Malacitana 36: 159-160. - Báez JC, Conde F, Flores-Moya A (2001) 97. Notas corológicas del macrofitobentos de Andalucía (Espana) V Acta Botanica Malacitana 26: 193-196. - Bermejo R, Pérez-Lloréns JL, Vergara JJ, Hernández I (2010) Notas corológicas del macrofitobentos de Andalucía (España) IX Acta Botanica Malacitana 35: 162-164. - Bermejo R, Pérez-Llorens JL, Vergara JJ, Hernández I (2012) 222. Notas corológicas del macrofitobentos marino de Andalucía (España) X Acta Botanica Malacitana 37: 163-165. - Bermejo R, Pérez-Llorens JL, Vergara JJ, Hernández I (2012) 248. Notas corológicas del macrofitobentos de Andalucía (España) XII Acta Botanica Malacitana 37: 163-165. - Conde F, Altamirano M, Flores-Moya A (1996) 57. Notas corológicas del macrofitobentos de Andalucía (España) IV Acta Botanica Malacitana 21: 303-305. - Conde F, Flores-Moya A, Vera González J (1990) Notas corológicas del macrofitobentos de Andalucía (España) II Acta Botanica Malacitana 15: 350-352. - Conde Poyales F, (1984) Catálogo de las algas macrobentónicas marinas de Málaga Acta Botanica Malacitana 9: 47-78. - Conde Poyales F, Soto J (1986) Notas corológicas del macrofitobentos de Andalucía (España) Acta Botanica Malacitana 11: 9-16. - Flores-Moya A, Conde F, Sánchez A, Altamirano M (1994) 44. Notas corológicas del macrofitobentos de Andalucía (España) III Acta Botanica Malacitana 19: 211-213. - Flores-Moya A, Vera González JJ, Conde Poyales F (1989) Contribución a la corología de las macroalgas marinas bentónicas del litoral malagueño. I Acta Botanica Malacitana 14: 199-201. - Guiry, M Guiry, G AlgaeBase. World-wide electronic publication. National University of Ireland, Galway http://www.algaebase.org. - Invernón V, Orriach R, Bañares E, Altamirano M, De la Rosa Álamos, J, Flores-Moya A (2009) Notas corológicas del macrofitobentos de Andalucía (España). VIII Acta Botanica Malacitana 34: 201-206. - Soto J, Conde Poyales F (1987) Sobre la presencia de algunas especies de algas tropicales en el litoral del sureste ibérico Acta Botanica Malacitana 12: 27-34.

追加のメタデータ

代替識別子 962e2f2e-f762-11e1-a439-00145eb45e9a
http://datos.gbif.es/collectory/public/show/co161
doi:10.15468/q8hzlc
https://ipt.gbif.es/resource?r=mgc_algae