MGC Herbarium of University of Malaga (Spain): MGC-PHYC dataset

Registro biológico Espécimen
Última versión publicado por University of Malaga el oct. 7, 2025 University of Malaga
Inicio:
http://www.mgc.uma.es
Fecha de publicación:
7 de octubre de 2025
Publicado por:
University of Malaga
Licencia:
CC-BY-NC 4.0

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Descripción

El Herbario de la Universidad de Málaga (Herbario MGC) está constituido por cuatro colecciones biológicas activas de pliegos de herbario. La colección de algas (MGC-PHYC) es una de las más importantes de este tipo en el Mediterráneo occidental. Su base de datos tiene como objetivo la digitalización y publicación de los datos asociados a los más de 5.450 ejemplares depositados actualmente en el herbario, de los cuales el 95% están identificados a nivel de especie.

Desde 2011, la Unidad de Herbario depende de los Servicios Centrales de Apoyo a la Investigación (SCAI) de la Universidad de Málaga, que son responsables de su gestión y de sus bases de datos. La colección crece de forma continua gracias a proyectos de investigación y donaciones históricas.

El 100% de la colección está digitalizada mediante el programa Elysia v3.0 (Pando et al., 2025), por lo que la información de los especímenes es accesible a través de la red GBIF (http://www.gbif.org/dataset/962e2f2e-f762-11e1-a439-00145eb45e9a). En la actualidad, MGC-PHYC incluye 112 familias y 904 taxones, distribuidos en rodófitas (54,6%), feófitas (29,2%), clorófitas (15,8%) y cianófitas (0,4%).

La mayoría de los pliegos proceden del Mediterráneo occidental, principalmente de España con un 76,6% de especímenes representados (Andalucía = 53,7% de los especímenes), siendo la provincia de Málaga la mejor representada con un 20,4%. También destacan las colecciones de Marruecos (9,1%), Japón (4,8%), Venezuela (2,7%) y la Antártida (1,4%).

La principal incorporación de ejemplares en la colección MGC-PHYC tuvo lugar entre 1975 y 1996, fruto de la intensa actividad del Dr. Francisco Conde. Posteriormente, las campañas de 2007 y 2008 se enmarcaron en proyectos destinados a completar la flora ficológica de Andalucía.

Además, la colección de algas del Herbario MGC alberga tres pequeñas colecciones catalogadas como históricas por su antigüedad y origen: un herbario de 198 ejemplares procedente de la Academia Malagueña de Ciencias donado en 1975 (Conde, 1992), otro de 80 pliegos donado por el Instituto de Investigaciones Pesqueras de Cádiz, y una colección de 61 preparaciones microscópicas donada por el Laboratorio Oceanográfico de Málaga.

La identificación de los especímenes ha sido realizada principalmente por especialistas en ficología, y la base de datos MGC-PHYC ha superado controles de calidad mediante DarwinTest v3.3 (Pando et al., 2022) y verificaciones ad hoc, cumpliendo con los estándares Darwin Core exigidos por GBIF.

Los datos de las colecciones del Herbario MGC son relevantes para estudios de conservación, taxonomía, flora, cartografía, fenología y palinología, entre otros. El Herbario MGC es uno de los herbarios de referencia para Flora iberica (Castroviejo, 1986–2012), Flora Vascular de Andalucía Oriental (Blanca et al., 2009), Flora Briofítica Ibérica (Guerra 2006–) y Flora Phycologica Iberica (Gómez-Garreta 2000–). Además, la revista Acta Botanica Malacitana (Acta Botanica Malacitana, 1975–) publica regularmente artículos basados en datos de la colección.

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The Herbarium of the University of Málaga (Herbarium MGC) is composed of four active biological collections of herbarium specimens. The algal collection (MGC-PHYC) is one of the most important of its kind in the western Mediterranean. Its database aims at the digitization and publication of data associated with the more than 5,450 specimens currently deposited in the herbarium, 95% of which are identified to species level.

Since 2011, the Herbarium Unit has been under the responsibility of the Central Research Support Services (SCAI) of the University of Málaga, which oversees its management and databases. The collection continues to grow thanks to research projects and historical donations.

The entire collection has been digitized using the software Elysia v3.0 (Pando et al., 2025), and specimen information is accessible through the GBIF network (http://www.gbif.org/dataset/962e2f2e-f762-11e1-a439-00145eb45e9a). At present, MGC-PHYC includes 112 families and 904 taxa, distributed among rhodophytes (54.6%), phaeophytes (29.2%), chlorophytes (15.8%) and cyanophytes (0.4%).

Most specimens come from the western Mediterranean, mainly from Spain, which accounts for 76.6% of the collection (Andalusia = 53.7% of the specimens), with Málaga province being the best represented area (20.4%). Other significant holdings include Morocco (9.1%), Japan (4.8%), Venezuela (2.7%) and Antarctica (1.4%).

The main incorporation of specimens into MGC-PHYC took place between 1975 and 1996, as a result of the intense collecting activity of Dr. Francisco Conde. Later, the 2007 and 2008 campaigns were conducted within projects aimed at completing the phycological flora of Andalusia.

In addition, the algal collection of the MGC Herbarium houses three small collections considered historical due to their age and provenance: a herbarium of 198 specimens from the Academia Malagueña de Ciencias donated in 1975 (Conde, 1992), another of 80 specimens donated by the Institute of Fisheries Research of Cádiz, and a collection of 61 microscopic preparations donated by the Oceanographic Laboratory of Málaga.

Specimen identification has been carried out mainly by specialists in phycology, and the MGC-PHYC database has passed quality controls using DarwinTest v3.3 (Pando et al., 2022) and ad hoc validations, meeting the Darwin Core standards required by GBIF.

The data from the MGC Herbarium collections are relevant for studies on conservation, taxonomy, flora, cartography, phenology, and palynology, among others. The MGC Herbarium is one of the reference herbaria for Flora iberica (Castroviejo, 1986–2012), Flora Vascular de Andalucía Oriental (Blanca et al., 2009), Flora Briofítica Ibérica (Guerra 2006–) and Flora Phycologica Iberica (Gómez-Garreta 2000–). In addition, the journal Acta Botanica Malacitana (Acta Botanica Malacitana, 1975–) regularly publishes articles based on data from the collection.

Registros

Los datos en este recurso de registros biológicos han sido publicados como Archivo Darwin Core(DwC-A), el cual es un formato estándar para compartir datos de biodiversidad como un conjunto de una o más tablas de datos. La tabla de datos del core contiene 5.449 registros.

también existen 2 tablas de datos de extensiones. Un registro en una extensión provee información adicional sobre un registro en el core. El número de registros en cada tabla de datos de la extensión se ilustra a continuación.

Occurrence (core)
5449
Identification 
6044
Multimedia 
14

Este IPT archiva los datos y, por lo tanto, sirve como repositorio de datos. Los datos y los metadatos del recurso están disponibles para su descarga en la sección descargas. La tabla versiones enumera otras versiones del recurso que se han puesto a disposición del público y permite seguir los cambios realizados en el recurso a lo largo del tiempo.

Versiones

La siguiente tabla muestra sólo las versiones publicadas del recurso que son de acceso público.

¿Cómo referenciar?

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MGC Herbarium of University of Malaga (Spain): MGC-PHYC dataset. University of Malaga. Dataset/Occurrence. http://www.gbif.es/ipt/resource?r=mgc-algae

Derechos

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El publicador y propietario de los derechos de este trabajo es University of Malaga. Esta obra está bajo una licencia Creative Commons de Atribución/Reconocimiento-NoComercial (CC-BY-NC 4.0).

Registro GBIF

Este recurso ha sido registrado en GBIF con el siguiente UUID: 962e2f2e-f762-11e1-a439-00145eb45e9a.  University of Malaga publica este recurso y está registrado en GBIF como un publicador de datos avalado por GBIF Spain.

Palabras clave

Malaga; Andalusia; Spain; Seagrass; SCAI; University of Malaga; MGC Herbarium; MGC; Plantae; Chromista; Bacteria; Clorophyta; Rhodophyta; Phaeophyta; Cyanophyta; Rhodomelaceae; Sargassaceae; Dictyotaceae; Corallinaceae; Ceramiaceae; Cystoseira; Codium; Ulva; Asparagopsis; Gelidium; Occurrence; Specimen; Occurrence

Contactos

José García Sánchez
  • Proveedor De Los Metadatos ●
  • Originador ●
  • Punto De Contacto
  • Herbarium Curator
University of Málaga
  • Servicios Centrales de Apoyo a la Investigación (SCAI). Bulevar Louis Pasteur, 33. Campus de Teatinos
29071 Málaga
Málaga
ES
  • +34 952137414

Cobertura geográfica

Most of the data refer to the western Mediterranean, mainly from Spain, which accounts for 76.6% of the collection (Andalusia = 53.7% of the specimens), with Málaga province being the best represented area (20.4%). In southern Spain, the collection provides a very comprehensive representation of the entire Málaga coastline, including emblematic sites such as Faro de Calaburras, La Araña and Peñón del Cuervo beaches, and the Maro–Cerro Gordo Cliffs Natural Area, which is shared with Granada province. Specimens from Morocco come mostly from Cabo Tres Forcas, Mar Chica, and Alhucemas. In Venezuela, the great majority of the material originates from Margarita Island. In Japan, all specimens were collected in the Seto Inland Sea. The collection also preserves material from Antarctica, mainly from the South Shetland Islands, Elephant Island, and South Georgia. Only 30% of the specimens are georeferenced. Data were originally recorded using UTM, MGRS, and geographic coordinates, and subsequently converted into geographic coordinates before being uploaded to the GBIF portal through the Elysia v3.0 software (Pando et al., 2025). The accuracy of the MGRS grid coordinates ranges from 1 m² to 10 km², while the accuracy of the geographic coordinates ranges from 1 to 7,071 m².

Coordenadas límite Latitud Mínima Longitud Mínima [-62,68, -158,22], Latitud Máxima Longitud Máxima [55,93, 135,15]

Cobertura taxonómica

The MGC-Algae collection comprises 5,450 sheets grouped into 112 families, 338 genera, 840 species, and 904 taxa (including infraspecific categories). Most specimens are red algae (Rhodophyta, 54.6%), followed by brown algae (Phaeophyta, 29.2%) and green algae (Chlorophyta, 15.8%). The most represented families, in order of abundance, are Rhodomelaceae (8.4%), Sargassaceae (7.3%), Dictyotaceae (7.1%), Corallinaceae (6.4%), and Ceramiaceae (5.0%). The leading genera, in order of abundance, are Cystoseira (4.6%), Codium (3.7%), Ulva (3.6%), Asparagopsis (3.3%), and Gelidium (3.2%).

Reino Plantae (plants), Chromista (chromista), Bacteria (bacteria)
Filo Clorophyta (green algae), Rhodophyta (red algae), Phaeophyta (brown algae), Cyanophyta (blue-green algae)
Familia Rhodomelaceae, Sargassaceae, Dictyotaceae, Corallinaceae, Ceramiaceae
Género Cystoseira, Codium, Ulva, Asparagopsis, Gelidium

Cobertura temporal

Fecha Inicial / Fecha Final 1831-01-01 / 2024-05-10

Datos del proyecto

No hay descripción disponible

Título Digitalización y Gestión de las Bases de Datos del Herbario MGC de la Universidad de Málaga
Fuentes de Financiación Scientific research project: "Informatización del Herbario de la Universidad de Málaga (MGC)". Reference: CLEG2004-21156-E Fund: Ministerio de Educación y Ciencia (Spain). Length: 2006 January - 2009 September.
Proyectos relacionados Scientific research project: "Realización de una prestación de servicios para el mantenimiento e inclusión de pliegos del proyecto Flora de Andalucía Oriental en el Herbario público de la Universidad de Málaga". Reference: 8.06/03.3353 Fund: Junta de Andalucía Length: 2010 February - 2011 February.
Scientific research project: "Digitalización y Gestión de las Bases de Datos del Herbario MGC de la Universidad de Málaga". Reference: 8.06/03.3353 Fund: Ministerio de Ciencia e Innovación (Spain). Subprograma Personal Técnico de Apoyo Length: 2012 January - 2014 December.
Scientific research project: LifeWatch ERIC EnBiC2-Lab – Flora Team. Reference: LIFEWATCH‑2019‑UMA‑01. Fund: Ministerio de Ciencia e Innovación (Spain) / Universidad de Málaga / FEDER. Program: LifeWatch ERIC, ERDF2020. Length: 2019 January – 2024 February.
Temporary staff for assistance in fieldworks, contracted through Junta de Andalucía (Spain) research group: Biodiversidad, Conservación y Recursos Vegetales; Group code: RNM-115.

Personas asociadas al proyecto:

Baltasar Cabezudo Artero
  • Investigador Principal

Métodos de muestreo

The specimens of this collection were mainly gathered by researchers from the Botany Area of the Department of Plant Biology at the University of Málaga, together with members of the MGC Herbarium. A smaller portion of the collection originates from exchanges and donations with other research centres and individual researchers.

Área de Estudio Most specimens come from southern Spain (Andalusia), with Málaga province being the best represented area, aiming to cover the widest possible diversity of seaweeds from this territory. The collection also includes material from northern Morocco, as well as from other regions of Spain, and from a total of 23 countries across all continents, including Antarctica.
Control de Calidad Identifications were carried out mainly by staff from the Department of Plant Biology at the University of Málaga, with a high percentage of the specimens revised by phycology specialists. Any taxonomic updates are incorporated into the database and made available through this dataset on GBIF. Before being published on the GBIF portal, the dataset is checked for digitisation errors. Validation is performed using the DarwinTest v3.3 tool (Pando et al., 2022), together with ad hoc verifications conducted through MS Access queries. These checks are designed to detect errors in taxonomy, dates, geospatial information, collectors, identifiers, and other fields.

Descripción de la metodología paso a paso:

  1. Pressing and drying. Algal material is first submerged in water so that the specimens spread naturally over the cardboard support. Fine adjustments are made with brushes to fully extend the thalli. Once arranged, the material is placed between absorbent papers covered with polyester sheets, which prevent the drying paper from sticking to the specimens. The prepared material is then pressed and dried before incorporation into the herbarium.
  2. Mounting. Specimens are mounted on double A2 standard-size sheets (42 × 59.4 cm) folded in half, which fully cover and protect the specimens.
  3. Labelling. Each sheet includes an identification label with the following information: taxonomy, country, province, county, locality, georeference, date, ecology, collectors, and determinations.
  4. Disinfestation. Although algal sheets are not at risk of being eaten by terrestrial insects, the same protocol as for the rest of the herbarium collections is followed as a preventive measure. Thus, sheets are frozen at −20 °C for 72 hours. In addition, the herbarium room is periodically fumigated.
  5. Storage. Specimens are stored in compact shelving cabinets and organised alphabetically by family, genus, and species.

Datos de la colección

Nombre de la Colección MGC-Algae
Identificador de la Colección 962e2f2e-f762-11e1-a439-00145eb45e9a
Identificador de la Colección Parental Not applicable
Métodos de preservación de los ejemplares Secado y prensado
Unidades curatoriales Conteo 5.450 +/- 0 Sheets ,  Conteo 904 +/- 0 Taxons ,  Conteo 840 +/- 0 Species ,  Conteo 338 +/- 0 Genus ,  Conteo 112 +/- 0 Families

Referencias bibliográficas

  1. PUBLICATIONS FROM THIS DATASET
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  3. REFERENCES CITED WITHIN THE METADATA
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  21. Altamirano, M., López-Blanco, E., & Orriach, R. (2008). Notas corológicas del macrofitobentos de Andalucía (España). VII. Acta Botanica Malacitana, 33, 329–332. https://doi.org/10.24310/abm.v33i0.6995
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  25. Bermejo, R., Pérez-Llorens, J. L., Vergara, J. J., & Hernández, I. (2012). Notas corológicas del macrofitobentos marino de Andalucía (España). X. Acta Botanica Malacitana, 37, 163–165. https://doi.org/10.24310/abm.v37i0.2660
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  30. Conde Poyales, F., & Soto, J. (1986). Notas corológicas del macrofitobentos de Andalucía (España). Acta Botanica Malacitana, 11, 9–16. https://doi.org/10.24310/Actabotanicaabmabm.v11i.9457
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  33. Guiry, M. D., & Guiry, G. M. (n.d.). AlgaeBase. World-wide electronic publication. National University of Ireland, Galway. Recuperado de http://www.algaebase.org
  34. Invernón, V., Orriach, R., Bañares, E., Altamirano, M., De la Rosa Álamos, J., & Flores-Moya, A. (2009). Notas corológicas del macrofitobentos de Andalucía (España). VIII. Acta Botanica Malacitana, 34, 201–206. https://doi.org/10.24310/abm.v34i0.6903
  35. Soto, J., & Conde, P. (1987). Sobre la presencia de algunas especies de algas tropicales en el litoral del sureste ibérico. Acta Botanica Malacitana, 12, 27–34. https://doi.org/10.24310/Actabotanicaabmabm.v12i.9730

Metadatos adicionales

Originally, this collection was published online under the name MGC-Algae, instead of retaining the name MGC-PHYC, which corresponds to the physical algal collection of the MGC Herbarium. In 2025, this inconsistency was corrected, and the online collection name was officially changed to MGC-PHYC.

Identificadores alternativos 962e2f2e-f762-11e1-a439-00145eb45e9a
http://datos.gbif.es/collectory/public/show/co161
doi:10.15468/q8hzlc
https://ipt.gbif.es/resource?r=mgc_algae