The rhizosphere microbiome of burned holm-oak: potential role of the genus Arthrobacter in the recovery of burned soils

資料紀錄

此資源sampling event的資料已發佈為達爾文核心集檔案（DwC-A），其以一或多組資料表構成分享生物多樣性資料的標準格式。 核心資料表包含 6 筆紀錄。

亦存在 1 筆延伸集的資料表。延伸集中的紀錄補充核心集中紀錄的額外資訊。 每個延伸集資料表中資料筆數顯示如下。

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版本

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如何引用

研究者應依照以下指示引用此資源。:

Fernández González A J (2022): The rhizosphere microbiome of burned holm-oak: potential role of the genus Arthrobacter in the recovery of burned soils. v1.3. Estación Experimental del Zaidín (CSIC). Dataset/Samplingevent. https://doi.org/10.15470/hhahsj

權利

研究者應尊重以下權利聲明。:

此資料的發布者及權利單位為 Estación Experimental del Zaidín (CSIC)。 This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY 4.0) License.

GBIF 註冊

此資源已向GBIF註冊，並指定以下之GBIF UUID: 90cc5e31-5b36-4814-abc6-205cb3beb92c。  Estación Experimental del Zaidín (CSIC) 發佈此資源，並經由GBIF Spain同意向GBIF註冊成為資料發佈者。

關鍵字

Samplingevent; Samplingevent; Metadata; Arthrobacter

聯絡資訊

地理涵蓋範圍

The soil samples were collected from Lanjarón, Sierra Nevada, Granada, Spain Undisturbed holm oak forest rhizosphere were collected at 1790 meters above sea level. Burned holm oak forest rhizosphere were collected at 1566 meters above sea level.

分類群涵蓋範圍

無相關描述

時間涵蓋範圍

計畫資料

El cambio global es un hecho constatado e incuestionable. Además de los procesos de tipo industrial existen otros factores, como los incendios forestales, que también contribuyen al calentamiento global dada la alta emisión de CO2 que producen. Disminuir la concentración de CO2 atmosférico, evitar su incremento o ayudar a su acumulación en la materia orgánica del suelo, se puede ver beneficiado por un correcto manejo del monte mediterráneo. Una rápida re-vegetación o recuperación de las formaciones autóctonas como son los encinares y robledales (Quercus ilex sp. rotundifolia y Q. pyrenaica) pueden ayudar en este sentido. Conocer las posibles etapas de modificación de estos bosques, expansión o regresión, por efecto del cambio climático también es importante, sobre todo si podemos contribuir a la progresión y al establecimiento de una mayor superficie de bosque. Los microorganismos del suelo son los responsables del cierre del ciclo biogeoquímico del carbono, contribuyendo además a la fertilidad del suelo y a la promoción del crecimiento vegetal. Por tanto en este proyecto se propone, la identificación de microorganismos indicadores que nos permitan seguir la evolución de la recuperación después de un incendio, la transición robledal-encinar y la progresión del robledal, como medida del cambio climático. Para ello se proponen los siguientes objetivos específicos: i) Análisis del fingerprint genético mediante TGGE de la diversidad microbiana y la redundancia funcional de fijación de N2 en los suelos bajo robles maduros y en progresión en alturas superiores. ii) Construcción y análisis de metagenomas de los suelos de encinar y robledal. iii) Secuenciación masiva del ADN ambiental extraído de un encinar y de un robledal maduros para la identificación de bioindicadores. iv) Monitorización, a los 2 y 4 años, de la evolución del encinar quemado y del robledal en progresión en altura mediante el empleo de los bioindicadores seleccionados.

參與計畫的人員:

取樣方法

Three sampling plots were randomly chosen within each study site along transects of 1.0 km length. At the BOF and UOF sites, we sampled the rhizosphere of three trees per plot, each with a diameter of at least 15 cm at breast height and separated by at least 5 m. Sampling took place on April 29, 2008 (3 years after the wildfire). Both sites were on a south-facing steep slope. The rhizospheric samples were collected from from holm oak rhizosphere soils by following the tree’s main roots until young cork-free roots were found at a distance of less than 50 cm from the trunk. The soil attached to the roots was manually removed and the roots with rhizospheric soil were put into 50 ml Falcon tubes filled with 20 ml of sterilized NaCl 0.8%. After shaking 25 min at 150 rpm and room temperature, the roots were removed and the tubes were centrifuged at 12,850 g for 5 min. The pelleted soil was used to extract environmental DNA. On the other hand, we processed up to 2 kg of soil from each site, sieved through a 2 mm mesh, for physicochemical analysis including soil type, pH, available water, total nitrogen, organic matter, electrical conductivity, etc. All these analyses were carried out with standardized procedures at the Food and Agriculture Laboratory of the Andalusian regional government at Atarfe (Granada, Spain).

方法步驟描述:

1. The methodological steps were publised in detail in the paper entitled: The rhizosphere microbiome of burned holm-oak: potential role of the genus Arthrobacter in the recovery of burned soils. With DOI: https://doi.org/10.1038/s41598-017-06112-3

收藏資料

額外的詮釋資料