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PAMP-tracheo: Vascular plants in Pamplona and surroundings (Navarra, Spain). Undergraduate thesis, R. Mayo

Última versión Publicado por University of Navarra – Department of Environmental Biology en Nov 30, 2018 University of Navarra – Department of Environmental Biology

This dataset provides information about 2287 preserved specimens from 509 species and subspecies and 61 families of vascular plants. The specimens were collected in the undergraduate thesis project of Mayo (1978), which assessed the vascular plants of the city of Pamplona and surroundings (Navarra, northern Spain).

Registros

Los datos en este registros biológicos recurso han sido publicados como Archivo Darwin Core(DwC-A), el cual es un formato estándar para compartir datos de biodiversidad como un conjunto de una o más tablas de datos. La tabla de datos del core contiene 2,287 registros.

Este IPT archiva los datos, sirviendo así como repositorio de datos. Los datos y metadatos están disponibles para descargar en la sección de descargas. La tabla de versiones muestra otras versiones del recurso que se han hecho accesibles al público y permite el seguimiento de los cambios hechos al recurso en el tiempo.

Descargas

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Versiones

La siguiente tabla muestra sólo las versiones publicadas del recurso que son de acceso público.

¿Cómo referenciar?

Los usuarios deben citar este trabajo de la siguiente manera:

Ibáñez R, Imas M, López M L, Mayo R M (2018): PAMP-tracheo: Vascular plants in Pamplona and surroundings (Navarra, Spain). Undergraduate thesis, R. Mayo. v1.2. University of Navarra – Department of Environmental Biology. Dataset/Occurrence. https://doi.org/10.15470/zhbplm

Derechos

Los usuarios deben respetar los siguientes derechos de uso:

El publicador y propietario de los derechos de este trabajo es University of Navarra – Department of Environmental Biology. This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0 License.

Registro GBIF

Este recurso ha sido registrado en GBIF con el siguiente UUID: a4442622-3162-4b2e-b47b-29828f7bb853.  University of Navarra – Department of Environmental Biology publica este recurso, y está registrado en GBIF como un publicador de datos avalado por GBIF Spain.

Palabras Clave

Occurrence; Specimen; flora; herbarium; Navarra; northern Spain; Pamplona; vascular plants

Contactos

¿Quién creó el recurso?:

Ricardo Ibáñez
Associate Professor
University of Navarra C/ Irunlarrea 1 E-31008 Pamplona Navarra ES +34948425600
María Imas
Technician
University of Navarra C/ Irunlarrea 1 E-31008 Pamplona Navarra ES +34948425600
María Luisa López
Emeritous Professor
University of Navarra C/ Irunlarrea 1 E-31008 Pamplona Navarra ES +34948425600
Rosa María Mayo
Student
University of Navarra C/ Irunlarrea 1 E-31008 Pamplona Navarra ES +34948425600

¿Quién puede resolver dudas acerca del recurso?:

Ricardo Ibáñez
Associate Professor
University of Navarra C/ Irunlarrea 1 E-31008 Pamplona Navarra ES +34948425600

¿Quién documentó los metadatos?:

Ricardo Ibáñez
Associate Professor
University of Navarra C/ Irunlarrea 1 E-31008 Pamplona Navarra ES +34948425600
María Imas
Technician
University of Navarra C/ Irunlarrea 1 E-31008 Pamplona Navarra ES +34948425600

¿Quién más está asociado con el recurso?:

Procesador
Leticia Orradre
Technician
University of Navarra C/ Irunlarrea 1 E-31008 Pamplona Navarra ES +34948425600

Cobertura Geográfica

Specimens were collected in the city of Pamplona (Navarra, northern Spain) and sourroundings. The site studied covers an area of over 23 km2. Country: Spain. Province: Navarra (N Spain). Municipality: Pamplona and other municipalities nearby.

Coordenadas límite Latitud Mínima Longitud Mínima [42.697, -1.827], Latitud Máxima Longitud Máxima [43.029, -1.491]

Cobertura Taxonómica

Out of a total of 2287 specimens, 2274 were identified to species or subspecies level. They belong to 509 species or subspecies and 61 families of vascular plants.

Filo  Tracheophyta (vascular plants)
Class  Equisetopsida (horsetails),  Liliopsida (monocots),  Magnoliopsida (dicotyledons),  Polypodiopsida (modern ferns)

Cobertura Temporal

Fecha Inicial / Fecha Final 1974-05-25 / 1978-11-27

Datos del Proyecto

The vascular flora of the city of Pamplona (northern Spain) and surroundings was assessed. An inventory was conducted based on fieldwork and taxa were identified.

Título Undergraduate thesis project R.M. Mayo: “Flora vascular de Pamplona y sus alrededores”.
Fuentes de Financiación Digitization and georeferencing of the herbarium specimens have been supported through the project: “Informatización y adecuación a la red GBIF de colecciones de plantas vasculares depositadas en el herbario de la Universidad de Navarra-PAMP. Fase II”. Reference: CGL2011-15056-E. Ministerio de Economía y Competitividad. Gobierno de España. Principal investigator: Ricardo Ibáñez.
Descripción del Área de Estudio The city is in the middle of Navarra (northern Spain), at 450 m.a.s.l., and is surrounded by a mountain belt with a height of about 1000 m.a.s.l. The area studied is close to the boundary between the Mediterranean and Eurosiberian biogeographical regions. The climate of Pamplona is oceanic with Mediterranean influences of some drier months in summer.

Personas asociadas al proyecto:

Investigador Principal
Rosa María Mayo
Investigador Principal
María Luisa López
Curador
María Imas
Procesador
Leticia Romeo Orradre
Investigador Principal
Ricardo Ibáñez

Métodos de Muestreo

Samples were collected between the years 1974 and 1978, but most of the specimens were collected in the last two years.

Área de Estudio The specimens were collected in the city of Pamplona (Navarra, northern Spain) and surroundings.

Descripción de la metodología paso a paso:

  1. Plant collection. Plant vouchers were selected and collected in the field.
  2. Identification to species or subspecies level. Identification was performed between 1974 and 1978 mainly by R.M. Mayo and M.L. López using Flora europaea (Tutin et al. 1964-1976) and Flore de la France (Coste 1900-1906).
  3. Plant conservation. Specimens were dried and pressed for conservation using standard protocols. Vouchers were deposited in the herbarium of the University of Navarra.
  4. Numbering and digitization of vouchers. From 2012 to date, each specimen was labelled, with a unique collection number, and digitized, using HERBAR software (v3.7.1 Pando et al. 1994-2010).
  5. Revision of species identification. Original identification of some herbarium specimens was revised. Between June 2013 and January 2018, the identification of 49 specimens was corrected and refined in 54, either by providing the specific or the subspecific epithet.
  6. Nomenclature was updated using Flora iberica (Castroviejo 1986-2015).
  7. Names of municipalities, localities and place names were updated according to Toponimia Oficial de Navarra (http://toponimianavarra.tracasa.es/).
  8. Georeferencing. Localities were georeferenced using geographic or UTM or coordinates. Datum and uncertainty were also assigned.
  9. Internet exportation. Data were exported from the HERBAR database under a Darwin Core format (Wieczorek et al. 2012).
  10. Data checking and validation. Coordinates, characters and format of dates were checked for possible mistakes using Darwin test software (v3.3, Ortega-Maqueda & Pando 2008). This software allowed validating data in the Darwin Core format.
  11. Metadata were documented and the dataset was published in the GBIF data portal using the Integrated Publishing Toolkit (IPT v2.3.5) of GBIF.es (http://ipt.gbif.es/).

Datos de la Colección

Nombre de la Colección Herbario PAMP: colección PAMPLONA_Mayo
Métodos de preservación de los ejemplares Secado y prensado
Unidades Curatoriales Conteo 2,287 +/- 1 sheets

Referencias Bibliográficas

  1. Mayo RM (1978): Flora vascular de Pamplona y alrededores. Undergraduate thesis. University of Navarra.
  2. Coste H (1900-1906). Flore descriptive et illustrée de la France, de la Corse et des contrées limitrophes. Libr. Des Scien. Nat. P. Klincksieek. Paris.
  3. Ortega-Maqueda I, Pando F (2008): DARWIN TEST (3.3): Una aplicación para la validación y el chequeo de los datos en formato Darwin Core 1.2, Darwin Core 1.4 o Darwin Core Archive. Unidad de Coordinación de GBIF.ES, CSIC, Ministerio de Economía y Competitividad, España. http://www.gbif.es/Darwin_test/Darwin_test.php
  4. Pando F et al. (1994–2010): HERBAR (3.7): Una aplicación de bases de datos para gestión de herbarios. Unidad de Coordinación de GBIF.ES, CSIC, Ministerio de Ciencia e Innovación, España. http://www.gbif.es/herbar/herbar.php
  5. Tutin TG, Heywood VH, Burges NA, Moore DM,Valentine DH, Walters SM & Webb DA (eds.) (1964-1976): Flora Europaea, Vols. 1-4, Cambridge UniversityPress, Cambridge.
  6. Wieczorek J, Bloom D, Guralnick R, Blum S, Döring M, Giovanni R, Robertson T, Vieglais D (2012): Darwin Core: An evolving community-developed biodiversity data standard. PLoS ONE 7(1): e29715. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0029715

Metadatos Adicionales

The origin of the PAMP Herbarium dates back to the arrival at the University of Navarra by Professor T.M. Losa España in 1964. One year later M.L. López Fernández began her doctoral thesis, maintaining her contributions to the herbarium uninterruptedly for several decades. Most of the material deposited in the herbarium comes from collections made by researchers from the Department of Environmental Biology (formerly Department of Botany) of the University of Navarra, as a result of theses and dissertations generally carried out in the territory of the Autonomous Community of Navarra (Spain). The herbarium store c. 100 000 sheets with dried specimens. The digitisation of the specimens has been done through the HERBAR v3.7.1 software (Pando et al., 1994-2010) and was supported by the Spanish Government (CGL2007-30978-E, CGL2009-08507-E and CGL2011-15056-E).

Identificadores Alternativos doi:10.15470/zhbplm
a4442622-3162-4b2e-b47b-29828f7bb853
https://ipt.gbif.es/resource?r=pamp-tracheo-pamplona_rm