ChromoDB: chromosome counts database for vascular plants

Событие
Последняя версия опубликовано Botany Section, Department of Biology, Health and Environment (University of Barcelona) июл. 14, 2026 Botany Section, Department of Biology, Health and Environment (University of Barcelona)

Скачайте последнюю версию данных этого ресурса в формате Darwin Core Archive (DwC-A) или метаданных ресурса в форматах EML или RTF:

Данные в формате DwC-A Скачать 206 378 Записи в English (14 MB) - Частота обновления: по мере необходимости
Метаданные в формате EML Скачать в English (16 KB)
Метаданные в формате RTF Скачать в English (10 KB)

Описание

ChromoDB is a curated database of chromosome counts for vascular plants compiled from published scientific literature. The dataset provides taxon names, accepted names when available, chromosome numbers expressed as n and/or 2n, geographic origin of the studied material when reported, bibliographic sources, and links to the corresponding ChromoDB records. This first GBIF release includes a selected subset of non-problematic records that have undergone taxonomic and bibliographic review. Additional information, updates, and extended contextual data are maintained in the ChromoDB web portal.

Записи данных

Данные этого находка ресурса были опубликованы в виде Darwin Core Archive (DwC-A), который является стандартным форматом для обмена данными о биоразнообразии в виде набора из одной или нескольких таблиц. Основная таблица данных содержит 206 378 записей.

Также в наличии 2 таблиц с данными расширений. Записи расширений содержат дополнительную информацию об основной записи. Число записей в каждой таблице данных расширения показано ниже.

Occurrence (core)
206378
Reference 
206378
MeasurementOrFacts 
206378

Данный экземпляр IPT архивирует данные и таким образом служит хранилищем данных. Данные и метаданные ресурсов доступны для скачивания в разделе Загрузки. В таблице версий перечислены другие версии ресурса, которые были доступны публично, что позволяет отслеживать изменения, внесенные в ресурс с течением времени.

Версии

В таблице ниже указаны только опубликованные версии ресурса, которые доступны для свободного скачивания.

Как оформить ссылку

Исследователи должны дать ссылку на эту работу следующим образом:

Simon J, Bosch M, Goncalves E, Blanché C (2026). ChromoDB: chromosome counts database for vascular plants. Version 2.1. Botany Section, Department of Biology, Health and Environment (University of Barcelona). Occurrence dataset. https://doi.org/10.15470/ninpvc

Права

Исследователи должны соблюдать следующие права:

Публикующей организацией и владельцем прав на данную работу является Botany Section, Department of Biology, Health and Environment (University of Barcelona). Эта работа находится под лицензией Creative Commons Attribution (CC-BY 4.0).

Регистрация в GBIF

Этот ресурс был зарегистрирован в GBIF, ему был присвоен следующий UUID: 58dd7802-12e3-47c4-af69-90d440fc8305.  Botany Section, Department of Biology, Health and Environment (University of Barcelona) отвечает за публикацию этого ресурса, и зарегистрирован в GBIF как издатель данных при оподдержке GBIF Spain.

Ключевые слова

Occurrence; chromosome counts; cytogenetics; vascular plants; plant chromosomes; karyology; taxonomy; bibliographic database; ChromoDB

Контакты

Joan Simon
  • Metadata Provider
  • Originator
  • Point Of Contact
  • Associate Professor
Universitat de Barcelona
08028 Barcelona
Barcelona
ES
Maria Bosch
  • Originator
  • Associate professor
Universitat de Barcelona
08028 Barcelona
Barcelona
ES
Estefany Goncalves
  • Originator
  • Assistant Professor
Universitat de Barcelona
08028 Barcelona
Barcelona
ES
Cèsar Blanché
  • Originator
  • Full Professor
Universitat de Barcelona
08028 Barcelona
Barcelona
ES

Географический охват

The dataset has global geographic scope. Geographic information refers to the reported origin of the material studied in the original chromosome-count publications, when available. Records with unclear or problematic geographic origin are excluded from this first GBIF release.

Ограничивающие координаты Юг Запад [-90, -180], Север Восток [90, 180]

Таксономический охват

This dataset covers vascular plants. The first GBIF release includes chromosome-count records for selected taxa whose names and bibliographic sources have been reviewed in ChromoDB.

Phylum Tracheophyta (vascular plants)

Данные проекта

ChromoDB is an ongoing project aimed at compiling, curating, and publishing chromosome-count data for vascular plants from scientific literature.

Название ChromoDB
Идентификатор https://chromodb.net
Описание района исследования The project focuses on chromosome-count data for vascular plants at global scale, based on published scientific literature.
Описание плана выполнения исследований The dataset is based on bibliographic extraction, taxonomic review, data cleaning, and progressive validation of chromosome-count records. This first GBIF release includes only selected non-problematic records.

Исполнители проекта:

Joan Simon

Методы сбора

Data were not generated through direct field sampling. Records were compiled from published chromosome-count studies and bibliographic sources. Each record corresponds to a chromosome-count report associated with a taxon, a reported geographic origin when available, and a bibliographic reference.

Охват исследования The study area is global and taxonomic in scope, covering chromosome-count data for vascular plants reported in published scientific literature.
Контроль качества Records included in this first GBIF release were selected after taxonomic and bibliographic review. Problematic records, unresolved names, unclear bibliographic sources, doubtful chromosome numbers, and records with insufficient information were excluded from this initial publication.

Описание этапа методики:

  1. 1. Chromosome-count records were extracted from published scientific literature. 2. Taxon names were reviewed and linked to accepted names when possible. 3. Chromosome numbers were recorded as n and/or 2n according to the original source. 4. Geographic origin of the studied material was recorded when explicitly reported. 5. Bibliographic references were checked and standardized when possible. 6. Records considered problematic or insufficiently documented were excluded from this first GBIF release.

Дополнительные метаданные

This GBIF dataset represents a standardized public release of selected ChromoDB records. The ChromoDB web portal may include additional fields, corrections, and more frequent updates than the GBIF-published version.

Благодарности
Введение
Приступая к работе
Цель
Описание частоты обновления ресурса The dataset will be updated progressively as additional ChromoDB records are curated, taxonomically checked, and bibliographically validated. The ChromoDB web portal may contain more frequent updates than the GBIF version.
Альтернативные идентификаторы 10.15470/ninpvc
58dd7802-12e3-47c4-af69-90d440fc8305
https://ipt.gbif.es/resource?r=chromodb