ChromoDB: chromosome counts database for vascular plants

Registro biológico
Última versión publicado por Botany Section, Department of Biology, Health and Environment (University of Barcelona) el jul 14, 2026 Botany Section, Department of Biology, Health and Environment (University of Barcelona)

Descargue la última versión de los datos como un Archivo Darwin Core (DwC-A) o los metadatos como EML o RTF:

Datos como un archivo DwC-A descargar 206.378 registros en Inglés (14 MB) - Frecuencia de actualización: cuando sea necesario
Metadatos como un archivo EML descargar en Inglés (16 KB)
Metadatos como un archivo RTF descargar en Inglés (10 KB)

Descripción

ChromoDB is a curated database of chromosome counts for vascular plants compiled from published scientific literature. The dataset provides taxon names, accepted names when available, chromosome numbers expressed as n and/or 2n, geographic origin of the studied material when reported, bibliographic sources, and links to the corresponding ChromoDB records. This first GBIF release includes a selected subset of non-problematic records that have undergone taxonomic and bibliographic review. Additional information, updates, and extended contextual data are maintained in the ChromoDB web portal.

Registros

Los datos en este recurso de registros biológicos han sido publicados como Archivo Darwin Core(DwC-A), el cual es un formato estándar para compartir datos de biodiversidad como un conjunto de una o más tablas de datos. La tabla de datos del core contiene 206.378 registros.

también existen 2 tablas de datos de extensiones. Un registro en una extensión provee información adicional sobre un registro en el core. El número de registros en cada tabla de datos de la extensión se ilustra a continuación.

Occurrence (core)
206378
Reference 
206378
MeasurementOrFacts 
206378

Este IPT archiva los datos y, por lo tanto, sirve como repositorio de datos. Los datos y los metadatos del recurso están disponibles para su descarga en la sección descargas. La tabla versiones enumera otras versiones del recurso que se han puesto a disposición del público y permite seguir los cambios realizados en el recurso a lo largo del tiempo.

Versiones

La siguiente tabla muestra sólo las versiones publicadas del recurso que son de acceso público.

¿Cómo referenciar?

Los usuarios deben citar este trabajo de la siguiente manera:

Simon J, Bosch M, Goncalves E, Blanché C (2026). ChromoDB: chromosome counts database for vascular plants. Version 2.1. Botany Section, Department of Biology, Health and Environment (University of Barcelona). Occurrence dataset. https://doi.org/10.15470/ninpvc

Derechos

Los usuarios deben respetar los siguientes derechos de uso:

El publicador y propietario de los derechos de este trabajo es Botany Section, Department of Biology, Health and Environment (University of Barcelona). Esta obra está bajo una licencia Creative Commons de Atribución/Reconocimiento (CC-BY 4.0).

Registro GBIF

Este recurso ha sido registrado en GBIF con el siguiente UUID: 58dd7802-12e3-47c4-af69-90d440fc8305.  Botany Section, Department of Biology, Health and Environment (University of Barcelona) publica este recurso y está registrado en GBIF como un publicador de datos avalado por GBIF Spain.

Palabras clave

Occurrence; chromosome counts; cytogenetics; vascular plants; plant chromosomes; karyology; taxonomy; bibliographic database; ChromoDB

Contactos

Joan Simon
  • Proveedor De Los Metadatos
  • Originador
  • Punto De Contacto
  • Associate Professor
Universitat de Barcelona
08028 Barcelona
Barcelona
ES
Maria Bosch
  • Originador
  • Associate professor
Universitat de Barcelona
08028 Barcelona
Barcelona
ES
Estefany Goncalves
  • Originador
  • Assistant Professor
Universitat de Barcelona
08028 Barcelona
Barcelona
ES
Cèsar Blanché
  • Originador
  • Full Professor
Universitat de Barcelona
08028 Barcelona
Barcelona
ES

Cobertura geográfica

The dataset has global geographic scope. Geographic information refers to the reported origin of the material studied in the original chromosome-count publications, when available. Records with unclear or problematic geographic origin are excluded from this first GBIF release.

Coordenadas límite Latitud Mínima Longitud Mínima [-90, -180], Latitud Máxima Longitud Máxima [90, 180]

Cobertura taxonómica

This dataset covers vascular plants. The first GBIF release includes chromosome-count records for selected taxa whose names and bibliographic sources have been reviewed in ChromoDB.

Filo Tracheophyta (vascular plants)

Datos del proyecto

ChromoDB is an ongoing project aimed at compiling, curating, and publishing chromosome-count data for vascular plants from scientific literature.

Título ChromoDB
Identificador https://chromodb.net
Descripción del área de estudio The project focuses on chromosome-count data for vascular plants at global scale, based on published scientific literature.
Descripción del diseño The dataset is based on bibliographic extraction, taxonomic review, data cleaning, and progressive validation of chromosome-count records. This first GBIF release includes only selected non-problematic records.

Personas asociadas al proyecto:

Joan Simon

Métodos de muestreo

Data were not generated through direct field sampling. Records were compiled from published chromosome-count studies and bibliographic sources. Each record corresponds to a chromosome-count report associated with a taxon, a reported geographic origin when available, and a bibliographic reference.

Área de Estudio The study area is global and taxonomic in scope, covering chromosome-count data for vascular plants reported in published scientific literature.
Control de Calidad Records included in this first GBIF release were selected after taxonomic and bibliographic review. Problematic records, unresolved names, unclear bibliographic sources, doubtful chromosome numbers, and records with insufficient information were excluded from this initial publication.

Descripción de la metodología paso a paso:

  1. 1. Chromosome-count records were extracted from published scientific literature. 2. Taxon names were reviewed and linked to accepted names when possible. 3. Chromosome numbers were recorded as n and/or 2n according to the original source. 4. Geographic origin of the studied material was recorded when explicitly reported. 5. Bibliographic references were checked and standardized when possible. 6. Records considered problematic or insufficiently documented were excluded from this first GBIF release.

Metadatos adicionales

This GBIF dataset represents a standardized public release of selected ChromoDB records. The ChromoDB web portal may include additional fields, corrections, and more frequent updates than the GBIF-published version.

Agradecimientos
Introducción
Primeros pasos
Propósito
Descripción de mantenimiento The dataset will be updated progressively as additional ChromoDB records are curated, taxonomically checked, and bibliographically validated. The ChromoDB web portal may contain more frequent updates than the GBIF version.
Identificadores alternativos 10.15470/ninpvc
58dd7802-12e3-47c4-af69-90d440fc8305
https://ipt.gbif.es/resource?r=chromodb