ChromoDB: chromosome counts database for vascular plants

Occurrence
Dernière version Publié par Botany Section, Department of Biology, Health and Environment (University of Barcelona) le juil. 14, 2026 Botany Section, Department of Biology, Health and Environment (University of Barcelona)

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Description

ChromoDB is a curated database of chromosome counts for vascular plants compiled from published scientific literature. The dataset provides taxon names, accepted names when available, chromosome numbers expressed as n and/or 2n, geographic origin of the studied material when reported, bibliographic sources, and links to the corresponding ChromoDB records. This first GBIF release includes a selected subset of non-problematic records that have undergone taxonomic and bibliographic review. Additional information, updates, and extended contextual data are maintained in the ChromoDB web portal.

Enregistrements de données

Les données de cette ressource occurrence ont été publiées sous forme dune Archive Darwin Core (Darwin Core Archive ou DwC-A), le format standard pour partager des données de biodiversité en tant quensemble dun ou plusieurs tableurs de données. Le tableur de données du cœur de standard (core) contient 206 378 enregistrements.

2 tableurs de données dextension existent également. Un enregistrement dextension fournit des informations supplémentaires sur un enregistrement du cœur de standard (core). Le nombre denregistrements dans chaque tableur de données dextension est illustré ci-dessous.

Occurrence (noyau)
206378
Reference 
206378
MeasurementOrFacts 
206378

Cet IPT archive les données et sert donc de dépôt de données. Les données et métadonnées de la ressource sont disponibles pour téléchargement dans la section téléchargements. Le tableau des versions liste les autres versions de chaque ressource rendues disponibles de façon publique et permet de tracer les modifications apportées à la ressource au fil du temps.

Versions

Le tableau ci-dessous naffiche que les versions publiées de la ressource accessibles publiquement.

Comment citer

Les chercheurs doivent citer cette ressource comme suit:

Simon J, Bosch M, Goncalves E, Blanché C (2026). ChromoDB: chromosome counts database for vascular plants. Version 2.1. Botany Section, Department of Biology, Health and Environment (University of Barcelona). Occurrence dataset. https://doi.org/10.15470/ninpvc

Droits

Les chercheurs doivent respecter la déclaration de droits suivante:

L’éditeur et détenteur des droits de cette ressource est Botany Section, Department of Biology, Health and Environment (University of Barcelona). Ce travail est sous licence Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0.

Enregistrement GBIF

Cette ressource a été enregistrée sur le portail GBIF, et possède lUUID GBIF suivante : 58dd7802-12e3-47c4-af69-90d440fc8305.  Botany Section, Department of Biology, Health and Environment (University of Barcelona) publie cette ressource, et est enregistré dans le GBIF comme éditeur de données avec lapprobation du GBIF Spain.

Mots-clé

Occurrence; chromosome counts; cytogenetics; vascular plants; plant chromosomes; karyology; taxonomy; bibliographic database; ChromoDB

Contacts

Joan Simon
  • Fournisseur Des Métadonnées
  • Créateur
  • Personne De Contact
  • Associate Professor
Universitat de Barcelona
08028 Barcelona
Barcelona
ES
Maria Bosch
  • Créateur
  • Associate professor
Universitat de Barcelona
08028 Barcelona
Barcelona
ES
Estefany Goncalves
  • Créateur
  • Assistant Professor
Universitat de Barcelona
08028 Barcelona
Barcelona
ES
Cèsar Blanché
  • Créateur
  • Full Professor
Universitat de Barcelona
08028 Barcelona
Barcelona
ES

Couverture géographique

The dataset has global geographic scope. Geographic information refers to the reported origin of the material studied in the original chromosome-count publications, when available. Records with unclear or problematic geographic origin are excluded from this first GBIF release.

Enveloppe géographique Sud Ouest [-90, -180], Nord Est [90, 180]

Couverture taxonomique

This dataset covers vascular plants. The first GBIF release includes chromosome-count records for selected taxa whose names and bibliographic sources have been reviewed in ChromoDB.

Phylum Tracheophyta (vascular plants)

Données sur le projet

ChromoDB is an ongoing project aimed at compiling, curating, and publishing chromosome-count data for vascular plants from scientific literature.

Titre ChromoDB
Identifiant https://chromodb.net
Description du domaine détude / de recherche The project focuses on chromosome-count data for vascular plants at global scale, based on published scientific literature.
Description du design The dataset is based on bibliographic extraction, taxonomic review, data cleaning, and progressive validation of chromosome-count records. This first GBIF release includes only selected non-problematic records.

Les personnes impliquées dans le projet:

Joan Simon

Méthodes déchantillonnage

Data were not generated through direct field sampling. Records were compiled from published chromosome-count studies and bibliographic sources. Each record corresponds to a chromosome-count report associated with a taxon, a reported geographic origin when available, and a bibliographic reference.

Etendue de létude The study area is global and taxonomic in scope, covering chromosome-count data for vascular plants reported in published scientific literature.
Contrôle qualité Records included in this first GBIF release were selected after taxonomic and bibliographic review. Problematic records, unresolved names, unclear bibliographic sources, doubtful chromosome numbers, and records with insufficient information were excluded from this initial publication.

Description des étapes de la méthode:

  1. 1. Chromosome-count records were extracted from published scientific literature. 2. Taxon names were reviewed and linked to accepted names when possible. 3. Chromosome numbers were recorded as n and/or 2n according to the original source. 4. Geographic origin of the studied material was recorded when explicitly reported. 5. Bibliographic references were checked and standardized when possible. 6. Records considered problematic or insufficiently documented were excluded from this first GBIF release.

Métadonnées additionnelles

This GBIF dataset represents a standardized public release of selected ChromoDB records. The ChromoDB web portal may include additional fields, corrections, and more frequent updates than the GBIF-published version.

Remerciements
Introduction
Premiers pas
Objet
Description de la fréquence de mise à jour The dataset will be updated progressively as additional ChromoDB records are curated, taxonomically checked, and bibliographically validated. The ChromoDB web portal may contain more frequent updates than the GBIF version.
Identifiants alternatifs 10.15470/ninpvc
58dd7802-12e3-47c4-af69-90d440fc8305
https://ipt.gbif.es/resource?r=chromodb