Descripción
This collection is a catalogue of the otolith part of the CBMR (ICM-CSIC) and associated to the data base AFORO. The database is regularly updated and at present (2023) it contains a total of 7905 high resolution images corresponding to 2716 species from 274 families at the CBMR of the Institut de Ciències del Mar (ICM-CSIC) from worldwide, especially in Mediterranean, Canary Islands, Antarctic and Namibian waters. Also, AFORO shows images from diverse atlases of otoliths (Rivaton & Bourret 1999; Leopold, van Damme, Philippart & Winter 2001; Campana 2004; Tuset, Lombarte & Assis 2008; Lin & Chang 201; Sadighzadeh, Tuset, Dadpour, Otero-Ferrer, Lombarte 2012; Volpedo, Thompson & Avigliano 2017). AFORO website (http://aforo.cmima.csic.es/) offers an online open catalogue of otolith images and its associated shape analysis through pattern recognition techniques applying wavelet analysis (WT), elliptic Fourier analysis (EFA) and classical morphometries, including relationship with fish length. The website also includes an Automatic Taxon Identification that allows to search and identify directly using query images of otoliths. The data base also is associated with Fishbase and Osteobase datbases. More information about the catalogue is here: https://scientiamarina.revistas.csic.es/index.php/scientiamarina/article/view/192
Registros
Los datos en este recurso de registros biológicos han sido publicados como Archivo Darwin Core(DwC-A), el cual es un formato estándar para compartir datos de biodiversidad como un conjunto de una o más tablas de datos. La tabla de datos del core contiene 9.394 registros.
Este IPT archiva los datos y, por lo tanto, sirve como repositorio de datos. Los datos y los metadatos del recurso están disponibles para su descarga en la sección descargas. La tabla versiones enumera otras versiones del recurso que se han puesto a disposición del público y permite seguir los cambios realizados en el recurso a lo largo del tiempo.
Versiones
La siguiente tabla muestra sólo las versiones publicadas del recurso que son de acceso público.
¿Cómo referenciar?
Los usuarios deben citar este trabajo de la siguiente manera:
Chic Ò, Manjabacas A, Guerrero E, Lombarte A (2023). Otoliths Reference Collection. CBMR-AFORO (ICM-CSIC). Version 1.11. Institut de Ciències del Mar (CSIC). Occurrence dataset. https://ipt.gbif.es/resource?r=aforo&v=1.11
Derechos
Los usuarios deben respetar los siguientes derechos de uso:
El publicador y propietario de los derechos de este trabajo es Institut de Ciències del Mar (CSIC). Esta obra está bajo una licencia Creative Commons de Atribución/Reconocimiento-NoComercial (CC-BY-NC 4.0).
Registro GBIF
Este recurso ha sido registrado en GBIF con el siguiente UUID: e95d0010-b3f1-11de-82f8-b8a03c50a862. Institut de Ciències del Mar (CSIC) publica este recurso y está registrado en GBIF como un publicador de datos avalado por GBIF Spain.
Palabras clave
Occurrence; otolith; otoliths; sagitta; fish otoliths; otolith shape; otolith database; automatic taxon identification; wavelet; Fourier; curvature space scale; 3D otoliths; marine
Contactos
- Originador
- Data Science Lab Manager
- Passeig Marítim de la Barceloneta, 37-49
- +34 93 230 95 00
- Proveedor De Los Metadatos ●
- Originador ●
- Punto De Contacto
- Technician
- Passeig Marítim de la Barceloneta, 37-49
- +34 93 230 95 00
- Proveedor De Los Metadatos ●
- Originador ●
- Punto De Contacto
- Curator
- Passeig Marítim de la Barceloneta, 37.
- +34 93 230 95 00
- Proveedor De Los Metadatos
- Researcher
- Passeig Marítim de la Barceloneta, 37-49
- +34 93 230 95 00
Cobertura geográfica
Species and families from the Mediterranean Sea, Antarctic Ocean (Weddell Sea, Ross Sea, Antarctic Peninsula), Atlantic Ocean (Argentina, Uruguay, South-western Islands, Gulf of Mexico, USA, Canada, Baltic Sea, North Sea, Ireland Sea, Cantabric Sea, Portugal, Madeira, Canary Islands, Morocco, Cabo Verde, Senegal, Gabon, Namibia), Indic Ocean (Madagascar, Tanzania, Red Sea, Iran) and Pacific (Australia, New Zealand, New Caledonia, Muroroa, Peru, Ecuador, Canada, Alaska).
| Coordenadas límite | Latitud Mínima Longitud Mínima [-90, -180], Latitud Máxima Longitud Máxima [90, 180] |
|---|
Cobertura taxonómica
No hay descripción disponible
| Reino | Animalia |
|---|---|
| Filo | Chordata |
| Orden | Acipenseriformes, Albuliformes, Anguilliformes, Argentiniformes, Atheriniformes, Aulopiformes, Batrachoidiformes, Beloniformes, Beryciformes, Characiformes, Clupeiformes, Cypriniformes, Cyprinodontiformes, Elopiformes, Gadiformes, Gasterosteiformes, Gasterostiformes, Gonorynchiformes, Lampridiformes, Lophiiformes, Mugiliformes, Myctophiformes, Ophidiiformes, Osmeriformes, Osteoglossiformes, Perciformes, Pleuronectiformes, Polymixiiformes, Salmoniformes, Scorpaeniformes, Siluriformes, Stephanoberyciformes, Stomiiformes, Tetraodontiformes, Zeiformes |
Cobertura temporal
| Época de existencia | 1975 |
|---|
Datos del proyecto
No hay descripción disponible
| Título | Project ION tools for the search, management and visualization of heterogenous data over Internet (Ref: MCyT - TIC2000-0376-p4-04) |
|---|---|
| Fuentes de Financiación | Ministerio Ciencia y Tecnología (MCyT) |
| Descripción del área de estudio | Otolith images and its associated shape analysis through pattern recognition techniques applying Fourier transform (FT), curvature space scale (CSS) and wavelet analysis (WT) are used in identification of stocks, populations and species as part of ecological, trophic , paleontological, archeological and fishery studies. This site also includes an Automatic Taxon Identification such allows to search and identify directly using query images of otholits. |
Personas asociadas al proyecto:
- Investigador Principal
Datos de la colección
| Nombre de la Colección | CBMR-AFORO |
|---|---|
| Identificador de la Colección | e95d0010-b3f1-11de-82f8-b8a03c50a862 |
| Identificador de la Colección Parental | Not applicable |
| Métodos de preservación de los ejemplares | Ningún tratamiento |
|---|
Metadatos adicionales
| Identificadores alternativos | e95d0010-b3f1-11de-82f8-b8a03c50a862 |
|---|---|
| doi:10.15468/wdwxid | |
| https://ipt.gbif.es/resource?r=aforo |