MGC Herbarium of University of Malaga (Spain): MGC-Cormof dataset

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Последняя версия опубликовано University of Malaga сент. 17, 2025 University of Malaga
Домой:
http://www.mgc.uma.es
Дата публикации:
17 сентября 2025 г.
Опубликовано:
University of Malaga
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CC-BY-NC 4.0

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Описание

El Herbario de la Universidad de Málaga (Herbario MGC) está constituido por cuatro colecciones biológicas activas de pliegos de herbario. La colección de plantas vasculares (MGC-Cormof) constituye la colección principal del herbario. Su base de datos tiene como objetivo la digitalización y publicación de los datos asociados a los más de 95.000 ejemplares depositados actualmente, de los cuales el 97,8% están identificados a nivel de especie.

Desde 2011, la Unidad de Herbario depende de los Servicios Centrales de Apoyo a la Investigación (SCAI) de la Universidad de Málaga, que son responsables de su gestión y de sus bases de datos. La colección crece de forma continua, con una media anual de unas 2.500 incorporaciones.

El 99% de la colección está digitalizada mediante el programa Elysia v3.0 (Pando et al., 2025), por lo que prácticamente todos los especímenes son accesibles a través de la red GBIF (http://www.gbif.org/dataset/962cceea-f762-11e1-a439-00145eb45e9a).

En la actualidad, MGC-Cormof incluye 247 familias y 8.274 taxones, distribuidos en angiospermas (92,28%), helechos y afines (6,46%) y gimnospermas (1,27%). Las familias y géneros más representados son Compositae, Gramineae, Leguminosae, Labiatae, Caryophyllaceae, Teucrium, Silene, Asplenium, Linaria y Quercus.

La mayoría de los especímenes proceden del Mediterráneo occidental, fundamentalmente del sur de España (96% de los ejemplares, de los cuales el 85,5% corresponden a Andalucía) y del norte de Marruecos (2%). Aproximadamente, el 72,2% de las muestras cuentan con coordenadas geográficas.

La identificación ha sido realizada mayoritariamente por personal del Departamento de Biología Vegetal de la Universidad de Málaga, estando un 36% de los ejemplares revisados por especialistas en taxonomía. La base de datos MGC-Cormof ha superado controles de calidad mediante DarwinTest v3.3 (Pando et al., 2022) y verificaciones ad hoc, cumpliendo con los estándares Darwin Core exigidos por GBIF.

Los datos de esta colección son relevantes para estudios de conservación, taxonomía, flora, cartografía, fenología y palinología, entre otros. El Herbario MGC es uno de los herbarios de referencia para Flora Iberica (Castroviejo, 1986–2021) y para la Flora Vascular de Andalucía Oriental (Blanca et al., 2009). Además, la revista Acta Botanica Malacitana (Acta Botanica Malacitana, 1975–) publica regularmente artículos basados en datos de la colección.

Description

The Herbarium of the University of Málaga (Herbarium MGC) is composed of four active biological collections of herbarium sheets. The vascular plant collection (MGC-Cormof) constitutes the main collection of the herbarium. Its database aims to digitize and publish the data associated with the more than 95,000 specimens currently deposited, of which 97.8% are identified to species level.

Since 2011, the Herbarium Unit has been under the responsibility of the Central Research Support Services (SCAI) of the University of Málaga, which oversee its management and databases. The collection continues to grow steadily, with an annual average of around 2,500 new accessions.

Ninety-nine percent of the collection has been digitized using the software Elysia v3.0 (Pando et al., 2025), which makes virtually all specimens accessible through the GBIF network (http://www.gbif.org/dataset/962cceea-f762-11e1-a439-00145eb45e9a). Currently, MGC-Cormof includes 246 families and 8,786 taxa, distributed among angiosperms (92.28%), ferns and allies (6.46%), and gymnosperms (1.27%). The most represented families and genera are Compositae, Gramineae, Leguminosae, Labiatae, Caryophyllaceae, Teucrium, Silene, Asplenium, Linaria, and Quercus.

Most specimens come from the western Mediterranean, mainly from southern Spain (96% of the specimens, of which 85.5% correspond to Andalusia) and northern Morocco (2%). Approximately 72.2% of the samples are georeferenced.

Identifications have been carried out mainly by staff of the Department of Plant Biology at the University of Málaga, with 36% of the specimens revised by taxonomic specialists. The MGC-Cormof database has passed quality controls using DarwinTest v3.3 (Pando et al., 2022) and ad hoc verifications, complying with the Darwin Core standards required by GBIF.

The data in this collection are relevant for studies on conservation, taxonomy, flora, mapping, phenology, and palynology, among others. Herbarium MGC is one of the reference herbaria for Flora Iberica (Castroviejo, 1986–2021) and the Flora Vascular de Andalucía Oriental (Blanca et al., 2009). In addition, the journal Acta Botanica Malacitana (Acta Botanica Malacitana, 1975–) regularly publishes articles based on data from the collection.

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Multimedia 
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MGC Herbarium of University of Malaga (Spain): MGC-Cormof dataset. University of Malaga. Dataset/Occurrence. http://www.gbif.es/ipt/resource?r=mgc_cormof

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Этот ресурс был зарегистрирован в GBIF, ему был присвоен следующий UUID: 962cceea-f762-11e1-a439-00145eb45e9a.  University of Malaga отвечает за публикацию этого ресурса, и зарегистрирован в GBIF как издатель данных при оподдержке GBIF Spain.

Ключевые слова

MGC; MGC Herbarium; University of Malaga; SCAI; Plantae; Cormophyta; Spermatophyta; Pteridophyta; Compositae; Leguminosae; Gramineae; Labiatae; Caryophyllaceae; Cruciferae; Scrophulariaceae; Cistaceae; Umbelliferae; Liliaceae; Western Mediterranean Region; Spain; Southern Spain; Southern Iberian Peninsula; Iberian Peninsula; Andalusia (Spain); Malaga province (Spain); Northern Morocco; Occurrence; Occurrence; Specimen

Контакты

José García Sánchez
  • Metadata Provider ●
  • Originator ●
  • Point Of Contact
  • Herbarium Curator
University of Málaga
  • Servicios Centrales de Apoyo a la Investigación - SCAI. Bulevar Louis Pasteur, 33. Campus de Teatinos
29071 Málaga
Málaga
ES
  • +34 952137414

Географический охват

Most of the data refer to the Western Mediterranean Region, mainly Southern Spain (96% of the specimens from Spain, of which 85.5% are from Andalusia) and Northern Morocco (2%). Andalusia consists of eight provinces, with Málaga being the most important (61% of the specimens), followed by Granada (8.3%) and Cádiz (7.1%). In addition, 19.6% of the data refer to other parts of Spain, and 4% to 53 countries in Europe, Africa, and South America. The MGC-Cormof collection includes a large number of plants from all the main Protected Areas of Málaga province, including Natural Parks (Sierra de las Nieves, Sierras de Tejeda, Almijara y Alhama, and Montes de Málaga) and Natural Areas (Los Reales de Sierra Bermeja, Torcal de Antequera, and Desfiladero de los Gaitanes). It also contains specimens from other Protected Areas in southern Spain, some of which are Natural Parks shared with Málaga (e.g., Los Alcornocales, Sierra de Grazalema) and the Protected Landscape “Corredor Verde del Guadiamar” (Green Corridor). Furthermore, many plants considered agricultural weeds, as well as specimens collected from roadsides, urban areas, and ornamental plants (1,400 sheets) from public parks and gardens in the city of Málaga, are represented. Seventy-two percent of the specimens are georeferenced. Almost all of them were originally recorded using the MGRS coordinate system and later converted into geographic coordinates before being uploaded to the GBIF portal through the Elysia v3.0 software (Pando et al., 2025). The accuracy of the MGRS grid coordinates ranges from 1 m² to 10 km², while the accuracy of the geographic coordinates ranges from 1 to 7,071 m².

Ограничивающие координаты Юг Запад [-34, -83,43], Север Восток [51,7, 116,05]

Таксономический охват

The MGC-Cormof collection comprises 94,288 sheets grouped into 246 families, 1,663 genera, 6,642 species, and 8,786 taxa (including infraspecific categories). Most specimens are angiosperms (92.28%), followed by ferns and fern allies (6.46%) and gymnosperms (1.27%). The most represented families, in order of abundance, are Compositae (10.6%), Gramineae (9.5%), Leguminosae (9.4%), Labiatae (6.9%), Caryophyllaceae (4.9%), Cruciferae (3.9%), Scrophulariaceae (3.6%), Cistaceae (3.0%), Umbelliferae (2.6%), and Liliaceae (2.1%). The leading genera, in order of abundance, are Teucrium (2.2%), Silene (1.6%), Asplenium (1.3%), Linaria (1.2%), Quercus (1.1%), Helianthemum (1.08%), Centaurea (1.06%), Galium (1.03%), Trifolium (1.02%), and Cistus (0.97%). Importantly, the collection includes a wide representation of plants from several Protected Areas in southern Spain (Cabezudo et al., 2005; Pérez Latorre et al., 1998, 1999, 2002), endemic species (Blanca et al., 2009; Salvo et al., 1983), threatened species (Blanca et al., 1999, 2000, 2009; Cabezudo et al., 2005; Salvo et al., 1983), invasive species (Dana et al., 2005), as well as ornamental plants and numerous arvensis species.

Kingdom Plantae (Plants)
Subkingdom Tracheophyta or Cormophyta (Tracheophytes, Cormophytes, Vascular Plants)
Family Compositae (Sunflowers), Leguminosae (Legumes), Gramineae (True Grasses), Labiatae (Mints), Caryophyllaceae (Pinks), Cruciferae (Crucifers or Mustard), Scrophulariaceae (Figworts), Cistaceae (Rock Roses), Umbelliferae (Parsley or Carrot family), Liliaceae (Lyli family)
Genus Teucrium (Germander), Silene (Campion), Asplenium (Petako Rauriki), Linaria (Spurred Snapdragon), Quercus (Oak), Centaurea (Knapweed), Helianthemum (Rock Rose), Cistus (Rock Rose), Trifolium (Clover), Galium (Bedstraw)

Временной охват

Дата начала / Дата окончания 1837-09-01 / 2024-05-16

Данные проекта

Описание отсутсвует

Название Digitalización y Gestión de las Bases de Datos del Herbario MGC de la Universidad de Málaga
Финансирование Scientific research project: "Informatización del Herbario de la Universidad de Málaga (MGC)". Reference: CLEG2004-21156-E Fund: Ministerio de Educación y Ciencia (Spain). Length: 2006 January - 2009 September.
Связанные проекты Scientific research project: "Realización de una prestación de servicios para el mantenimiento e inclusión de pliegos del proyecto Flora de Andalucía Oriental en el Herbario público de la Universidad de Málaga". Reference: 8.06/03.3353 Fund: Junta de Andalucía Length: 2010 February - 2011 February.
Scientific research project: "Digitalización y Gestión de las Bases de Datos del Herbario MGC de la Universidad de Málaga". Reference: 8.06/03.3353 Fund: Ministerio de Ciencia e Innovación (Spain). Subprograma Personal Técnico de Apoyo Length: 2012 January - 2014 December.
Scientific research project: LifeWatch ERIC EnBiC2-Lab – Flora Team. Reference: LIFEWATCH‑2019‑UMA‑01. Fund: Ministerio de Ciencia e Innovación (Spain) / Universidad de Málaga / FEDER. Program: LifeWatch ERIC, ERDF2020. Length: 2019 January – 2024 February.
Temporary staff for assistance in fieldworks, contracted through Junta de Andalucía (Spain) research group: Biodiversidad, Conservación y Recursos Vegetales; Group code: RNM-115.

Исполнители проекта:

Baltasar Cabezudo Artero
  • Principal Investigator
José García Sánchez
  • Metadata Provider ●
  • Editor ●
  • Curator ●
  • Programmer ●
  • Publisher ●
  • Reviewer ●
  • Point Of Contact

Методы сбора

Most specimens in the collection were gathered by researchers from the Botany Area of the Department of Plant Biology at the University of Malaga, as well as by members of the herbarium staff. A smaller portion of the collection comes from exchanges or donations provided by other research centres or individual researchers.

Охват исследования Most plants come from southern Spain (Andalusia), with Malaga province being the most widely represented area. The aim of the collection is to cover the greatest possible diversity of plant species from this territory. In addition, the collection includes specimens from northern Morocco, various regions of Spain, and several countries in Europe, Africa, and South America.
Контроль качества Every specimen in the MGC-Cormof collection has been identified by researchers from the Botany Area of the Department of Plant Biology at the University of Malaga. In addition, 40% of the specimens have subsequently been taxonomically revised as part of regional or national floristic studies or taxonomic revisions. Any taxonomic update is incorporated into the database and made available through this dataset in GBIF. Before being uploaded to the GBIF Portal, the dataset is analysed for digitisation errors. This validation is performed using the DarwinTest v3.3 tool (Pando et al., 2022), together with ad hoc verifications conducted through MS Access queries. These checks are designed to detect errors in taxonomy, dates, geospatial information, collectors, identifiers, and other fields. As part of this process, all specimen records attributed to “J. Lara Ruiz” were removed from the dataset, as his herbarium vouchers contain uncertain information.

Описание этапа методики:

  1. Pressing and drying. Plant material is pressed and dried before incorporation into the herbarium.
  2. Digitisation. The specimen information recorded in the field notebook is entered into the local collection database using ELYSIA.
  3. Labelling and sheet preparation. Labels are printed on sheets using a plotter, containing the following information: taxonomy, country, province, county, locality, georeference, date, ecology, collectors, and determinations.
  4. Mounting. Specimens are mounted on the printed sheets (double A2 standard-size, 42 × 59.4 cm, folded in half), which fully cover and protect the specimens.
  5. Disinfestation. To eliminate any insects, sheets are frozen at −20 °C for 72 hours. In addition, the herbarium room is periodically fumigated.
  6. Storage. Specimens are stored in compact shelving cabinets and organised into three main taxonomic groups: pteridophytes, gymnosperms, and angiosperms. Within each group, specimens are arranged alphabetically by family, genus, and species.

Данные коллекции

Название коллекции MGC-Cormof
Идентификатор коллекции 962cceea-f762-11e1-a439-00145eb45e9a
Идентификатор родительской коллекции NA
Методы сохранения образцов Dried and pressed
Единицы хранения Кол-во 94 288 +/- 0 Sheets ,  Кол-во 6 642 +/- 0 Species ,  Кол-во 1 663 +/- 0 Genus ,  Кол-во 246 +/- 0 Families ,  Кол-во 8 786 +/- 0 Taxa

Библиографические ссылки

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Дополнительные метаданные

Альтернативные идентификаторы 962cceea-f762-11e1-a439-00145eb45e9a
http://datos.gbif.es/collectory/public/show/co163
doi:10.15468/2gfyxk
https://ipt.gbif.es/resource?r=mgc_cormof