MGC Herbarium of University of Malaga (Spain): MGC-Bryof dataset

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Последняя версия опубликовано University of Malaga окт. 7, 2025 University of Malaga
Домой:
http://www.mgc.uma.es
Дата публикации:
7 октября 2025 г.
Опубликовано:
University of Malaga
Лицензия:
CC-BY-NC 4.0

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Описание

El Herbario de la Universidad de Málaga (Herbario MGC) está constituido por cuatro colecciones biológicas activas de pliegos de herbario. La colección de briófitos (MGC-Bryof) integra los musgos, hepáticas y antoceros del herbario. Su base de datos tiene como objetivo la digitalización y publicación de los datos asociados a los más de 6.750 ejemplares depositados actualmente en el herbario, de los cuales el 98,4% están identificados a nivel de especie.

Desde 2011, la Unidad de Herbario depende de los Servicios Centrales de Apoyo a la Investigación (SCAI) de la Universidad de Málaga, que son responsables de su gestión y de sus bases de datos. La colección crece de forma continua, con una media anual de unas 500 incorporaciones.

El 99% de la colección está digitalizada mediante el programa Elysia v3.0 (Pando et al., 2025), por lo que prácticamente todos los especímenes son accesibles a través de la red GBIF (https://www.gbif.org/dataset/96bfeedc-f762-11e1-a439-00145eb45e9a). En la actualidad, MGC-Bryof incluye 92 familias y 672 taxones, distribuidos en musgos (88,70%), hepáticas (10,74%) y antoceros (0,56%). Las familias y géneros más representados son Pottiaceae, Brachytheciaceae, Grimmiaceae, Orthotrichaceae, Bryaceae, Grimmia, Bryum, Syntrichia, Orthotrichum y Homalothecium.

La mayoría de los pliegos proceden de la Península Ibérica y Canarias, predominantemente del sur de España (Andalucía = 88,5% de los especímenes), siendo la provincia de Málaga la mejor representada con un 84,2%. Destacar que, aproximadamente, el 86% de las muestras cuentan con coordenadas geográficas.

Una de las principales incorporaciones de pliegos en la colección MGC-Bryof se dio entre 1976 y 1986, años que reflejan la intensa actividad del Dr. Juan Guerra. Posteriormente se ha registrado el principal evento de incorporación de especímenes al herbario, entre los años 2017 y 2024, en muestreos llevados a cabo por el Dr. Baltasar Cabezudo y el Dr. Juan Guerra en proyectos destinados a ampliar el conocimiento del Parque Nacional Sierra de las Nieves, el Parque Natural de Grazalema, el Parque Natural de los Alcornocales, el Parque Natural Montes de Málaga y la Comarca de La Axarquía malagueña.

La identificación ha sido realizada mayoritariamente por personal del Departamento de Biología Vegetal de la Universidad de Málaga y de la Universidad de Murcia, estando más de un 92% de los ejemplares revisados por especialistas en taxonomía. La base de datos MGC-Bryof ha superado controles de calidad mediante DarwinTest v3.3 (Pando et al., 2022) y verificaciones ad hoc, cumpliendo con los estándares Darwin Core exigidos por GBIF.

Los datos de las colecciones del Herbario MGC son relevantes para estudios de conservación, taxonomía, flora, cartografía, fenología y palinología, entre otros. El Herbario MGC es uno de los herbarios de referencia para Flora iberica (Castroviejo, 1986–2012), Flora Vascular de Andalucía Oriental (Blanca et al., 2009), Flora Briofítica Ibérica (Guerra 2006–) y Flora Phycologica Iberica (Gómez-Garreta 2000–). Además, la revista Acta Botanica Malacitana (Acta Botanica Malacitana, 1975–) publica regularmente artículos basados en datos de la colección.

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Herbarium of the University of Málaga (MGC Herbarium) consists of four active biological collections of herbarium sheets. The bryophyte collection (MGC-Bryof) integrates the mosses, liverworts, and hornworts of the herbarium. Its database aims to digitize and publish the data associated with the more than 6,750 specimens currently deposited in the herbarium, of which 98.4% are identified at the species level.

Since 2011, the Herbarium Unit has been under the Central Research Support Services (SCAI) of the University of Málaga, which are responsible for its management and databases. The collection grows continuously, with an annual average of about 500 new specimens.

Ninety-nine percent of the collection is digitized through the program Elysia v3.0 (Pando et al., 2025), so practically all specimens are accessible through the GBIF network (https://www.gbif.org/dataset/96bfeedc-f762-11e1-a439-00145eb45e9a). Currently, MGC-Bryof includes 92 families and 672 taxa, distributed into mosses (88.70%), liverworts (10.74%), and hornworts (0.56%). The most represented families and genera are Pottiaceae, Brachytheciaceae, Grimmiaceae, Orthotrichaceae, Bryaceae, Grimmia, Bryum, Syntrichia, Orthotrichum, and Homalothecium.

Most specimens come from the Iberian Peninsula and the Canary Islands, predominantly from southern Spain (Andalusia = 88.5% of the specimens), with Málaga province being the best represented, accounting for 84.2%. Notably, approximately 86% of the samples include geographic coordinates.

One of the main incorporations of specimens in the MGC-Bryof collection occurred between 1976 and 1986, years that reflect the intense activity of Dr. Juan Guerra. Later, the most significant incorporation event took place between 2017 and 2024, during surveys carried out by Dr. Baltasar Cabezudo and Dr. Juan Guerra in projects aimed at expanding the knowledge of Sierra de las Nieves National Park, Grazalema Natural Park, Los Alcornocales Natural Park, Montes de Málaga Natural Park, and the Axarquía region of Málaga.

Identification has been performed mainly by staff of the Department of Plant Biology at the University of Málaga and the University of Murcia, with more than 92% of the specimens revised by taxonomy specialists. The MGC-Bryof database has undergone quality controls through DarwinTest v3.3 (Pando et al., 2022) and ad hoc verifications, complying with the Darwin Core standards required by GBIF.

The data from the MGC Herbarium collections are relevant for studies on conservation, taxonomy, flora, cartography, phenology, and palynology, among others. The MGC Herbarium is one of the reference herbaria for Flora iberica (Castroviejo, 1986–2012), Flora Vascular de Andalucía Oriental (Blanca et al., 2009), Flora Briofítica Ibérica (Guerra 2006–), and Flora Phycologica Iberica (Gómez-Garreta 2000–). In addition, the journal Acta Botanica Malacitana (Acta Botanica Malacitana, 1975–) regularly publishes articles based on data from the collection.

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MGC Herbarium of University of Malaga (Spain): MGC-Briof dataset. University of Malaga. Dataset/Occurrence. http://www.gbif.es/ipt/resource?r=mgc_briof

Права

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Публикующей организацией и владельцем прав на данную работу является University of Malaga. Эта работа находится под лицензией Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC 4.0).

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Этот ресурс был зарегистрирован в GBIF, ему был присвоен следующий UUID: 96bfeedc-f762-11e1-a439-00145eb45e9a.  University of Malaga отвечает за публикацию этого ресурса, и зарегистрирован в GBIF как издатель данных при оподдержке GBIF Spain.

Ключевые слова

Occurrence; Malaga; Andalusia; Spain; SCAI; University of Malaga; MGC Herbarium; MGC; Plantae; Bryophyta; Pottiaceae; Brachytheciaceae; Grimmiaceae; Orthotrichaceae; Bryaceae; Grimmia; Bryum; Syntrichia; Orthotrichum; Homalothecium; Specimen; Occurrence

Контакты

Jose Garcia Sánchez
  • Metadata Provider ●
  • Originator ●
  • Point Of Contact
  • Herbarium Curator
University of Málaga
  • Servicios Centrales de Apoyo a la Investigación (SCAI). Bulevar Louis Pasteur, 33. Campus de Teatinos
29071 Málaga
Málaga
ES
  • +34 952137414

Географический охват

Most of the data refer to the Iberian Peninsula and the Canary Islands, predominantly from southern Spain (Andalusia = 88.5% of the specimens), with Málaga province being the best represented, accounting for 84.2%. The MGC-Bryof collection includes a large number of specimens from the main Protected Areas of Málaga province, including the Sierra de las Nieves National Park, the Sierras de Tejeda, Almijara y Alhama and Montes de Málaga Natural Parks, and the Los Reales de Sierra Bermeja and Torcal de Antequera Natural Areas. It also contains material from other Protected Areas in southern Spain, some of which are Natural Parks shared with Málaga (e.g., Los Alcornocales, Sierra de Grazalema). Eighty-six percent of the specimens are georeferenced. Almost all were originally recorded using the MGRS coordinate system and later converted into geographic coordinates before being uploaded to the GBIF portal through the Elysia v3.0 software (Pando et al., 2025). The accuracy of the MGRS grid coordinates ranges from 1 m² to 10 km², while the accuracy of the geographic coordinates ranges from 1 to 7,071 m².

Ограничивающие координаты Юг Запад [28,138, -17,215], Север Восток [43,641, 3,224]

Таксономический охват

The MGC-Bryof collection comprises 6,749 sheets grouped into 92 families, 235 genera, 599 species, and 672 taxa (including infraspecific categories). Most specimens are mosses (88.70%), followed by liverworts (10.74%) and hornworts (0.56%). The most represented families, in order of abundance, are Pottiaceae (24.4%), Brachytheciaceae (12.0 %), Grimmiaceae (7.9 %), Orthotrichaceae (7.8%) and Bryaceae (5.9%). The leading genera, in order of abundance, are Grimmia (6.7 %), Bryum (5.8 %), Syntrichia (3.8 %), Orthotrichum (3.4%), and Homalothecium (3.3%).

Kingdom Plantae (plants)
Phylum Bryophyta (mosses)
Family Pottiaceae, Brachytheciaceae, Grimmiaceae, Orthotrichaceae, Bryaceae
Genus Grimmia, Bryum, Syntrichia, Orthotrichum, Homalothecium

Временной охват

Дата начала / Дата окончания 1987-01-01 / 2024-03-21

Данные проекта

Описание отсутсвует

Название Digitalización y Gestión de las Bases de Datos del Herbario MGC de la Universidad de Málaga
Финансирование Scientific research project: "Informatización del Herbario de la Universidad de Málaga (MGC)". Reference: CLEG2004-21156-E Fund: Ministerio de Educación y Ciencia (Spain). Length: 2006 January - 2009 September.
Связанные проекты Scientific research project: "Realización de una prestación de servicios para el mantenimiento e inclusión de pliegos del proyecto Flora de Andalucía Oriental en el Herbario público de la Universidad de Málaga". Reference: 8.06/03.3353 Fund: Junta de Andalucía Length: 2010 February - 2011 February.
Scientific research project: "Digitalización y Gestión de las Bases de Datos del Herbario MGC de la Universidad de Málaga". Reference: 8.06/03.3353 Fund: Ministerio de Ciencia e Innovación (Spain). Subprograma Personal Técnico de Apoyo Length: 2012 January - 2014 December.
Scientific research project: LifeWatch ERIC EnBiC2-Lab – Flora Team. Reference: LIFEWATCH‑2019‑UMA‑01. Fund: Ministerio de Ciencia e Innovación (Spain) / Universidad de Málaga / FEDER. Program: LifeWatch ERIC, ERDF2020. Length: 2019 January – 2024 February.
Temporary staff for assistance in fieldworks, contracted through Junta de Andalucía (Spain) research group: Biodiversidad, Conservación y Recursos Vegetales; Group code: RNM-115.

Исполнители проекта:

Baltasar Cabezudo Artero
  • Principal Investigator
Jose Garcia Sánchez
  • Metadata Provider ●
  • Editor ●
  • Curator ●
  • Programmer ●
  • Publisher ●
  • Reviewer ●
  • Point Of Contact

Методы сбора

The specimens in this collection were mainly gathered by researchers from the Botany Area of the Department of Plant Biology at the University of Málaga, as well as by members of the herbarium. A smaller portion of the collection comes from exchanges or donations from other research centers or individual researchers.

Охват исследования Most specimens come from the Iberian Peninsula, mainly southern Spain (Andalusia), with Málaga province being the most widely represented area. The collection aims to cover the broadest possible range of plant biodiversity in this territory.
Контроль качества Identifications were carried out mainly by staff from the Department of Plant Biology at the University of Málaga and the University of Murcia, with more than 92% of the specimens revised by taxonomic specialists. Any taxonomic updates are incorporated into the database and made available through this dataset on GBIF. Before being published on the GBIF portal, the dataset is checked for digitisation errors. Validation is performed using the DarwinTest v3.3 tool (Pando et al., 2022), together with ad hoc verifications conducted through MS Access queries. These checks are designed to detect errors in taxonomy, dates, geospatial information, collectors, identifiers, and other fields.

Описание этапа методики:

  1. Drying. Samples are dried before being incorporated into the herbarium.
  2. Digitisation. Specimen information recorded in the field notebook is entered into the local collection database using ELYSIA.
  3. Envelope preparation. In this collection, a double-envelope system is used for mounting the sheets. Specimen data from the database are printed directly onto the envelopes. Each sample is assigned an inner envelope (16.2 × 11.4 cm) and a larger outer envelope (18.7 × 13.2 cm). The inner envelope protects the specimen itself, while the outer envelope allows the sheet to be handled and stored without exposing the specimen.
  4. Mounting. The field-collected specimen is placed inside the prepared inner envelope, which is then inserted into the outer envelope. The outer envelope is attached to the herbarium sheet, completing the mounting process. The inner envelope can be sent separately if required on a loan.
  5. Disinfestation. To eliminate any insects, vouchers are frozen at −20 °C for 72 hours. In addition, the herbarium room is periodically fumigated.
  6. Storage. Specimens are stored in compact shelving cabinets and organised alphabetically by genus and species.

Данные коллекции

Название коллекции MGC-Briof
Идентификатор коллекции 96bfeedc-f762-11e1-a439-00145eb45e9a
Идентификатор родительской коллекции Not applicable
Методы сохранения образцов Dried and pressed
Единицы хранения Кол-во 6 751 +/- 0 Sheets ,  Кол-во 645 +/- 0 Taxa ,  Кол-во 599 +/- 0 Species ,  Кол-во 233 +/- 0 Genus ,  Кол-во 92 +/- 0 Families

Библиографические ссылки

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  3. García-Sánchez, J., & Cabezudo, B. (2014). El herbario MGC de la Universidad de Málaga. Boletín de la Asociación de Herbarios Ibero-Macaronésicos (AHIM), 16, 20–26.
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  24. Guerra, J., Montes, J., Jiménez, J. A., Cano, M. J., Gallego, M. T., Rodríguez, O., & Cabezudo, B. (2023). Contribución al conocimiento de la flora briofítica de la comarca de la Axarquía y la ZEC Sierra de Camarolos (Málaga, España). Acta Botanica Malacitana, 48, 1–13. https://doi.org/10.24310/abm.v48i.16177
  25. Guerra, J., Ruiz de Clavijo, E., & Sergio, C. (1986). Sobre la distribución de Riella helicophylla (Bory et Mont.) Mont. en la Península Ibérica. Acta Botanica Malacitana, 11, 75–76. https://doi.org/10.24310/Actabotanicaabmabm.v11i.9461
  26. Lasala, E. F. (1983). El género Crossidium Jur. en la Península Ibérica; Islas Baleares, Canarias y Madeira. Anales del Jardín Botánico de Madrid, 40(1), 29–35.

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https://colecciones.gbif.es/public/show/co162
doi:10.15468/fcqlb1
https://ipt.gbif.es/resource?r=mgc_briof