Herbarium of Vascular Plants Collection of the University of Extremadura (Spain)

Occurrence
Последняя версия опубликовано Dep. of Plant Biology, Ecology and Earth Sciences, Botany Area, Univ. Extremadura июл. 2, 2024 Dep. of Plant Biology, Ecology and Earth Sciences, Botany Area, Univ. Extremadura

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Описание

The herbarium of University of Extremadura (UNEX Herbarium) is formed by 38.341 specimens of vascular plants whose main origin is the autonomous region of Extremadura (Spain) and Portugal, although it also contains a smaller number of specimens from different places, including the rest of peninsular Spain, the Balearic Islands, the Macaronesian region (Canary Islands, Madeira and Azores), northwest of Africa (Morocco) and Brazil. Almost the 98% of the total records are georeferenced. It is an active collection in continuous growth. Its data can be accessed through the GBIF data portal at https://ipt.gbif.es/manage/resource?r=collectionherbariumextremadura In the paper Espinosa & López (2013) are described the specimens associated data set of the UNEX Herbarium, with the objective of disseminate the information contained in the data set for promote the multiple uses of it. Established in 1986, the specimens incorporated in the herbarium of vascular plants collection of University of Extremadura (UNEX Herbarium), are the result of the work of collection and identification by different researchers associated with the Botany Area (Department of Plant Biology, Ecology and Earth Sciences) of the University of Extremadura. Chief amongst these include: Professor Juan Antonio Devesa, founder and director of the herbarium until 2004; Trinidad Ruiz, curator and director since 2004 to 2020; Rafael Tormo, curator until 2019; Josefa López, curator and current director; Tomás Rodríguez, curator; Ana Ortega and Francisco Javier Valtueña. Other researchers who contributed to the growth of the UNEX Herbarium include, Mª Carmen Viera, Jacinto Pedro Carrasco, Adolfo Muñoz, Inmaculada Montero, and Francisco Mª Vázquez. In addition, the disinterested work developed throughout time by a lot of students of the University of Extremadura, especially, Mª Luisa Navarro Pérez. The development of different research projects has made it possible to improve the quality of the herbarium. Among them, the numerous compilations carried out by different members of the Botany Area in order to elaborate the first flora of the Extremadura region (Devesa, 1995) or the synthesis of different taxonomic families or genera for Flora Ibérica (http://www.floraiberica.org/). Additionally, 4.5% of the material comes from the purchase of part of the herbarium of Dr. J.V.C. Malato-Beliz. Limited and unpredictable funding has always been a challenge for ensuring sustained growth of the collection facility since its origin.

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Rodríguez-Riaño T, Ortega-Olivencia A, Ruiz T, López J (2020). Herbarium UNEX, Herbarium of Vascular Plants Collection of the University of Extremadura (Spain). Dataset/Occurrence. https://ipt.gbif.es/resource?r=collectionherbariumextremadura

Права

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Публикующей организацией и владельцем прав на данную работу является Dep. of Plant Biology, Ecology and Earth Sciences, Botany Area, Univ. Extremadura. Эта работа находится под лицензией Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC 4.0).

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Ключевые слова

Pteridophytes; seed plants; Extremadura; herbarium collection; Spain; Portugal; Baleares islands; Macaronesian region; Morocco; Brazil; Mediterranean area; UNEX Herbarium.; Occurrence; Occurrence

Контакты

Tomás Rodríguez Riaño
  • Metadata Provider
  • Curator
  • Originator
  • Associated Party
Área de Botánica, Facultad de Ciencias, Universidad de Extremadura
  • Avda. de Elvas s/n
06006 Badajoz
Badajoz
ES
  • +34924289300 ext. 86962
Josefa López Martínez
  • Principal Investigator
  • Associated Party
Área de Botánica, Facultad de Ciencias, Universidad de Extremadura
  • Avda. de Elvas s/n
06006 Badajoz
Badajoz
ES
  • +34924289300 ext. 86869
Josefa López Martínez
  • Principal Investigator
  • Directora del Herbario
Área de Botánica, Facultad de Ciencias, Universidad de Extremadura
  • Avda. de Elvas s/n
06006 Badajoz
Badajoz
ES
  • +34924289300 ext. 86869
Ana Ortega Olivencia
  • Content Provider
  • Associated Party
Área de Botánica, Facultad de Ciencias, Universidad de Extremadura
  • Avda. de Elvas s/n
06006 Badajoz
Badajoz
ES
  • +34924289300 ext. 86963
Francisco Javier Valtueña Sánchez
  • Content Provider
  • Associated Party
Área de Botánica, Facultad de Ciencias, Universidad de Extremadura
  • Avda. de Elvas s/n
06006 Badajoz
Badajoz
ES
  • +34924289300 ext.86968
Marta Fernández Ramos
  • Custodian Steward
  • Associated Party
Área de Botánica, Facultad de Ciencias, Universidad de Extremadura
  • Avda. de Elvas s/n
06006 Badajoz
Badajoz
ES
  • +34924289423 ext.89423
Herbario UNEX
  • Point Of Contact
  • Associated Party
Área de Botánica, Facultad de Ciencias, Universidad de Extremadura
  • Avda. de Elvas s/n
06006 Badajoz
Badajoz
ES
  • +34924289423 ext.89423

Географический охват

According to the data collected in Espinosa & López (2013), specimens deposited in the UNEX Herbarium have been collected mainly from Iberian Peninsula (Spain and Portugal), northwest of Africa (Morocco) and Brazil. Maximum number of specimens included in the dataset are collected from Spain (31490) followed by Portugal (3488), Brazil (722) and Morocco (111) respectively. Regarding to Spanish provinces, Badajoz contributes 16910 specimens, followed by Cáceres (6855 specimens) and Cádiz (1012 specimens). Other sampling areas include Almería (711 specimens), Jaén (495 specimens), Málaga (411 specimens), Gerona (388 specimens), Huesca (371 specimens), León (308 specimens), Oviedo (293 specimens), Granada (290 specimens), Huelva (260 specimens) and Lérida (249 specimens). The specimens better represented in the database correspond to elements of the Mediterranean forest and/or scrubland. These specimens are developed under a seasonal climate of mild winters and hot and dry summers, with abundant rainfall in autumn and spring. Frequent in this climate are forest fires, to which the vegetation is adapted. Specimens from Brazil (except one specimen collected in the state of Santa Catarina), are collected in the state of Río Grande do Sul. This state has a humid subtropical climate and a hydrography classified into three major regions: Uruguay River Basin, Guaiba River, and Litoral.

Ограничивающие координаты Юг Запад [-38, -115], Север Восток [52, 65]

Таксономический охват

Majority of the specimens in UNEX Herbarium belong to class Magnoliopsida (27143 specimens) and Liliopsida (8508 specimens). These classes are followed by Filicopsida (505 specimens), Lycopsida (138 specimens), Coniferopsida (104 specimens), Equisetopsida (24 specimens), Ophioglossopsida (14 specimens), Gnetopsida (6 specimens), Taxopsida (4 specimens) Cycadopsida and Gingkgopsida (both with 2 specimens), and Psilotopsida (1 specimen). UNEX herbarium represents 210 families, of which 22% and 21% of the specimens belongs to Poaceae and Fabaceae family respectively. This is followed by Asteraceae (15%), Scrophulariaceae (6%), Lamiaceae (6%), Caryophyllacae (5%), Brassicaceae (4%), Cyperaceae (4%), Rubiaceae (3%), Ranunculaceae (3%), Liliaceae (3%), Boraginaceae (3%), Apiaceae (3%), and Cistaceae (2%). The herbarium includes 1253 genera (Figure 3), significant ones amongst them are Trifolium (1345 specimens), Ranunculus (623 specimens), Scrophularia (583 specimens), Vicia (537 specimens), Stipa(505 specimens), Galium (479 specimens), Juncus (439 specimens), Vulpia (381 specimens), Medicago (365 specimens) and Bromus (342 specimens) (Espinosa & López, 2013).

Kingdom Plantae
Phylum Pteridophyta, Spermatophyta
Class Magnoliopsida, Liliopsida, Filicopsida, Lycopsida, Coniferopsida, Equisetopsida, Ophioglossopsida, Gnetopsida, Taxopsida, Cycadopsida, Gingkgopsida, Psilotopsida
Family Acanthaceae, Aceraceae, Adiantaceae, Agavaceae, Aizoaceae, Alismataceae, Amaranthaceae, Amaryllidaceae, Anacardiaceae, Apiaceae, Apocynaceae, Aquifoliaceae, Araceae, Araliaceae, Araucariaceae, Arecaceae, Aristolochiaceae, Asclepiadaceae, Aspidiaceae, Aspleniaceae, Asteraceae, Athyriaceae, Azollaceae, Balanophoraceae, Balsaminaceae, Basellaceae, Begoniaceae, Berberidaceae, Betulaceae, Bignoniaceae, Blechnaceae, Boraginaceae, Brassicaceae, Buddlejaceae, Butomaceae, Buxaceae, Cactaceae, Callitrichaceae, Calycanthaceae, Calyceraceae, Campanulaceae, Cannabaceae, Cannaceae, Capparaceae, Caprifoliaceae, Caryophyllaceae, Casuarinaceae, Celastraceae, Ceratophyllaceae, Characeae, Chenopodiaceae, Cistaceae, Clethraceae, Clusiaceae, Cneoraceae, Commelinaceae, Convolvulaceae, Coriariaceae, Cornaceae, Crassulaceae, Cryptogrammaceae, Cucurbitaceae, Cunoniaceae, Cupressaceae, Cyathaceae, Cycadaceae, Cyperaceae, Davalliaceae, Dicksoniaceae, Dioscoreaceae, Dipsacaceae, Droseraceae, Ebenaceae, Elaeagnaceae, Elaphoglossaceae, Elatinaceae, Empetraceae, Ephedraceae, Equisetaceae, Ericaceae, Euphorbiaceae, Fabaceae, Fagaceae, Flacourtiaceae, Fontinalaceae, Frankeniaceae, Fumariaceae, Gentianaceae, Geraniaceae, Gesneriaceae, Ginkgoaceae, Globulariaceae, Grossulariaceae, Guttiferaceae, Haloragaceae, Hamamelidaceae, Hemionitidaceae, Hippocastanaceae, Hydrangeaceae, Hydrophyllaceae, Hymenophyllaceae, Hypolepidaceae, Iridaceae, Isoetaceae, Juglandaceae, Juncaceae, Juncaginaceae, Lamiaceae, Lauraceae, Lemnaceae, Lentibulariaceae, Liliaceae, Linaceae, Loranthaceae, Lycopodiaceae, Lythraceae, Magnoliaceae, Malpighiaceae, Malvaceae, Maranthaceae, Marsileaceae, Melastomataceae, Meliaceae, Melianthaceae, Mimosaceae, Molluginaceae, Monimiaceae, Moraceae, Myoporaceae, Myricaceae, Myrsinaceae, Myrtaceae, Najadaceae, Nyctaginaceae, Nymphaeaceae, Oleaceae, Onagraceae, Ophioglossaceae, Orchidaceae, Orobanchaceae, Osmundaceae, Oxalidaceae, Paeoniaceae, Papaveraceae, Passifloraceae, Phytolaccaceae, Pinaceae, Piperaceae, Pittosporaceae, Plantaginaceae, Platanaceae, Plumbaginaceae, Poaceae, Podocarpaceae, Polemoniaceae, Polygalaceae, Polygonaceae, Polypodiaceae, Pontederiaceae, Portulacaceae, Potamogetonaceae, Primulaceae, Proteaceae, Psilotaceae, Pteridaceae, Punicaceae, Pyrolaceae, Rafflesiaceae, Ranunculaceae, Resedaceae, Rhamnaceae, Rosaceae, Rubiaceae, Ruppiaceae, Rutaceae, Salicaceae, Santalaceae, Sapindaceae, Saxifragaceae, Scrophulariaceae, Selaginellaceae, Simaroubaceae, Sinopteridaceae, Solanaceae, Sparganiaceae, Sterculiaceae, Styracaceae, Symplocaceae, Tamaricaceae, Taxaceae, Theaceae, Theligonaceae, Thelypteridaceae, Thymelaeaceae, Tiliaceae, Tropaeolaceae, Typhaceae, Ulmaceae, Umbelliferaceae, Urticaceae, Valerianaceae, Verbenaceae, Violaceae, Vitaceae, Zannichelliaceae, Zingiberaceae, Zygophyllaceae

Временной охват

Период формирования 1986-presente

Данные проекта

Описание отсутсвует

Название NA

Исполнители проекта:

NA

Методы сбора

Taking into account that the specimens deposited in the UNEX Herbarium comes from diverse regions which is outcome of several research projects depositing the specimens, they are not collected using a single, uniform protocol. By one hand, regarding the materials from donations or purchases (e.g. herbarium of Dr. J.V.C. Malato-Beliz) the protocol followed for the collection of specimens is unknown. By the other hand, the methodology used in collecting plants by researchers from the Botany Area may change depending on the objectives pursued by the work they are carried out for (Espinosa & López, 2013). But in general, collection takes place following previous available references drawn from scientific works, herbarium material or indications from reliable collectors.

Охват исследования Iberian Peninsula is the most significant geographic zone represented in UNEX Herbarium. Over 5000 specimens are collected from two provinces (Badajoz and Cáceres). Other two provinces, Cádiz and Almería, contributed specimens in the range of 500-1500. Out of the Iberian Peninsula, the specimens collected from Morocco (111 sheets) represent an area greater than 50% of the country. Conversely, specimens from Brazil (721 sheets) do not cover more than 3% of the area of the country (Espinosa & López, 2013).
Контроль качества Each specimen and associated data record was subjected to two quality procedures; (a) taxonomic determination or identification and (b) geo-referencing. For taxonomic identification, trusted experts were contacted, the 85% of the material has been identified by investigators of the Botany Area of the University of Extremadura. These experts have authored number of monographs, which include Vegetación y Flora de Extremadura (Devesa 1995) in which 2050 taxa’s were described (Espinosa & López, 2013). Other includes Las Gramíneas de Extremadura (Devesa, 1999) or the volumes of Flora iberica XV (Devesa et al., 2007) comprising the taxonomic synthesis of families Adoxaceae, Caprifoliaceae, Dipsacaceae, Rubiaceae and Valerianaceae, and XVI (under edition, see http://www.floraiberica.org/) in which these experts are responsible for the genera Arctium, Atractylis, Carlina, Crupina, Cynara, Echinops, Onopordum, Rhaponticum, Saussurea, Staehelina, and Xeranthemum. It is worth also to note the publications of new species of flora (Centaurea bethurica, Devesa and López 2008; Scrophularia fontqueri Ortega-Olivencia and Devesa 1998; Galiummoralesianum and G. talaveranum Ortega-Olivencia and Devesa 2003; Galium belizianum Ortega-Olivencia et al. 2004), whose typus are preserved in UNEX Herbarium. Besides the above mentioned authoritative literature, experts have also relied upon the biology of the reproduction of different taxa of the family Fabaceae (López et al. 1998, 1999a, 1999b, 2000, Ortega-Olivencia and Devesa 1997, Ortega-Olivencia et al. 1997, 2005, Rodríguez-Riaño et al. 1999a, 1999b, 1999c, 2004, 2006, Valtueña et al. 2007, 2008a, 2008b, 2010a, 2010b, 2011, 2012) or the genera Drosophyllum (Ortega-Olivencia et al. 1995, 1998) or Scrophularia (Ortega-Olivencia and Devesa 1993a, 1993b, Ortega-Olivencia et al. 2012, Valtueña et al. 2013). Use of these literature resources and long standing experience of the researchers, give a high degree of confidence to the taxonomic identification of the specimens (Espinosa & López, 2013). As the data say in Espinosa & López (2013), 98% of the records in the collection are georeferenced. A total of 58.38% have MGRS coordinates and the rest geographical coordinates. The MGRS coordinate system has been transformed into geographical coordinates through a geographic calculator (http://www.asturnatura.com/sinflac/calculadora-conversiones-coordenadas.php), while at the same time maintaining the MGRS coordinates in the database. The accuracy of these coordinates’ grids varies from 1 km2 to 10 km2. The geographical coordinates have been taken through the description of localities and search of these localities in Google Earth. The accuracy of geographic coordinate values also varies between 2 and 12 km depending on the number of decimal places contained.

Описание этапа методики:

  1. The following protocol is described in Espinosa & López (2013). Dried and pressed method has been adopted for preservation of the specimens deposited in the collection. After collection of specimens in the field they are pressed and dried with the aim of adapting them to a flat surface and remove water from the tissue, thereby preventing their degeneration or attacks by bacteria, fungi or insects that would destroy them. The dried material is mounted on a holder constituted by an A3 cardboard (42 × 29.7 cm) and a resistant paper (so-called jacket) dimension A2 (42 × 59.4 cm) that perfectly covers the cardboard, thus protecting the specimen. The assembly is made on the cardboard with transparent tape, allowing both that the specimen be tighten to the holder and that the assembly be aesthetic. After assembly, specimens are registered and labeled. Registration is done in a database (Microsoft Office Access Database → DarwinCore 1.2) in which each specimen is assigned a reference number allocated consecutively. The information contained in the record of each specimen is: institution owner of the herbarium, reference number, scientific name of the family and species, date of collection, georeferencing data (country, province, and town), habitat, Legitimavit, and Determinavit. All log data are printed and constitute the sheet label. Before putting the specimens in the herbarium they are stored in hermetic plastic boxes and kept for 48 hours in cold storage (freezers) at -40°C. In this way the material is decontaminated from possible attacks of pathogens that can destroy them and the rest of material wich is already in the herbarium. Finally, the specimens are kept inside compact enclosures in shelves where they are arranged taking into account the four main groups: pteridophytes, gymnosperms, monocotyledons and dicotiledons. Within each main group the specimens are alphabetical arranged by families and genera.

Данные коллекции

Название коллекции UNEX Herbarium, University of Extremadura.
Идентификатор коллекции Herbarium of Vascular Plants Collection of the University of Extremadura (Spain) (gbif.org)
Идентификатор родительской коллекции No aplica
Методы сохранения образцов Dried and pressed
Единицы хранения Кол-во 38 341 +/- 0 Specimens

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Дополнительные метаданные

Альтернативные идентификаторы 835d30de-f762-11e1-a439-00145eb45e9a
doi:10.15468/l8vpay
https://ipt.gbif.es/resource?r=collectionherbariumextremadura