Descrição
Registros de Dados
Os dados deste recurso de ocorrência foram publicados como um Darwin Core Archive (DwC-A), que é o formato padronizado para compartilhamento de dados de biodiversidade como um conjunto de uma ou mais tabelas de dados. A tabela de dados do núcleo contém 7.933 registros.
This IPT archives the data and thus serves as the data repository. The data and resource metadata are available for download in the downloads section. The versions table lists other versions of the resource that have been made publicly available and allows tracking changes made to the resource over time.
Versões
A tabela abaixo mostra apenas versões de recursos que são publicamente acessíveis.
Como citar
Pesquisadores deveriam citar esta obra da seguinte maneira:
Tree cavities as keystone microhabitats: ecosystem function and conservation in Iberian quercus forests (Fungi)
Direitos
Pesquisadores devem respeitar a seguinte declaração de direitos:
O editor e o detentor dos direitos deste trabalho é Estación Experimental de Zonas Áridas (CSIC). This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC 4.0) License.
GBIF Registration
Este recurso foi registrado no GBIF e atribuído ao seguinte GBIF UUID: 0d2f3b66-8e5f-4632-8aa9-54fbfdd6d36b. Estación Experimental de Zonas Áridas (CSIC) publica este recurso, e está registrado no GBIF como um publicador de dados aprovado por GBIF Spain.
Palavras-chave
Samplingevent; metabarcoding; cavity; forest management; biodiversity; Quercus rotundifolia; Observation
Contatos
- Originador ●
- Ponto De Contato
https://orcid.org/0000-0002-1463-8393
- Originador
- Originador ●
- Ponto De Contato
- Ponto De Contato
Cobertura Geográfica
Cabañeros y Monfragüe National parks
| Coordenadas delimitadoras | Sul Oeste [-90, -180], Norte Leste [90, 180] |
|---|
Cobertura Taxonômica
N/A
| Reino | Fungi |
|---|---|
| Filo | Blastocladiomycota, Mucoromycota, Sanchytriomycota, Glomeromycota, Ascomycota, Basidiomycota, Chytridiomycota |
| Class | Rhizophydiomycetes, Wallemiomycetes, Tremellomycetes, Atractiellomycetes, Mortierellomycetes, Microbotryomycetes, Glomeromycetes, Malasseziomycetes, Dothideomycetes, Candelariomycetes, Eurotiomycetes, Lecanoromycetes, Chytridiomycetes, Exobasidiomycetes, Sordariomycetes, Saccharomycetes, Sanchytriomycetes, Mucoromycetes, Dacrymycetes, Arthoniomycetes, Agaricomycetes, Cystobasidiomycetes, Ustilaginomycetes, Taphrinomycetes, Pezizomycetes, Xylonomycetes, Leotiomycetes, Orbiliomycetes, Agaricostilbomycetes |
Cobertura Temporal
| Data Inicial / Data final | 2024-05-13 / 2024-05-16 |
|---|
Dados Sobre o Projeto
Nenhuma descrição disponível
| Título | Impacto global sobre la formación de cavidades y la diversidad oculta en Parques Mediterráneos |
|---|---|
| Identificador | SPIP2023-029955 |
| Financiamento | Ministerio para la Transicion Ecologica y el Reto Demografico. Organismo autonomo de Parques Nacionales |
O pessoal envolvido no projeto:
Métodos de Amostragem
Metabarcoding of wood samples from tree cavities, extracted using an sterilized drill
| Área de Estudo | Cabañeros and Monfragüe National Parks. Selected old Quercus rotundifolia stands |
|---|
Descrição dos passos do método:
- Sampels were obtained using an sterilized drill. DNA was extracted from each sample using the DNeasy PowerSoil Pro kit (Qiagen). The fungal ITS2 region (~330 bp) was amplified using primers ITS3 and ITS4 in a two-step PCR protocol enabling sample multiplexing. Libraries were purified, quantified, pooled in equimolar amounts, and sequenced on a NovaSeq PE250 platform (Illumina), targeting ~4 Gb total output. Adapter removal and primer trimming were performed with Cutadapt. Sequence quality was assessed using FastQC and summarized with MultiQC (Ewels et al. 2016). Reads were quality filtered, denoised, merged, and chimera-checked using DADA2. Amplicon sequence variants were clustered into OTUs at 97 % similarity using DECIPHER to account for multiple ITS copies within fungal genomes as well as intraspecific sequence variation. Taxonomic assignment was performed against the UNITE database using the DADA2 classifier and independently validated using the GBIF Sequence ID tool with BLASTN searches. Final taxonomy was curated combining both approaches, field observations, and phylogenetic analyses.
Metadados Adicionais
| Acknowledgements | |
|---|---|
| Propósito | |
| Descrição da manutenção | Actualización de los datos o adición de algún campo si es necesario |
| Identificadores alternativos | 10.15470/krdxel |
| 0d2f3b66-8e5f-4632-8aa9-54fbfdd6d36b | |
| https://ipt.gbif.es/resource?r=cavdivfungi |