説明
データ レコード
この オカレンス（観察データと標本) リソース内のデータは、1 つまたは複数のデータ テーブルとして生物多様性データを共有するための標準化された形式であるダーウィン コア アーカイブ (DwC-A) として公開されています。 コア データ テーブルには、7,933 レコードが含まれています。
この IPT はデータをアーカイブし、データ リポジトリとして機能します。データとリソースのメタデータは、 ダウンロード セクションからダウンロードできます。 バージョン テーブルから公開可能な他のバージョンを閲覧でき、リソースに加えられた変更を知ることができます。
バージョン
次の表は、公にアクセス可能な公開バージョンのリソースのみ表示しています。
引用方法
研究者はこの研究内容を以下のように引用する必要があります。:
Tree cavities as keystone microhabitats: ecosystem function and conservation in Iberian quercus forests (Fungi)
権利
研究者は権利に関する下記ステートメントを尊重する必要があります。:
パブリッシャーとライセンス保持者権利者は Estación Experimental de Zonas Áridas (CSIC)。 This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC 4.0) License.
GBIF登録
このリソースをはGBIF と登録されており GBIF UUID: 0d2f3b66-8e5f-4632-8aa9-54fbfdd6d36bが割り当てられています。 GBIF Spain によって承認されたデータ パブリッシャーとして GBIF に登録されているEstación Experimental de Zonas Áridas (CSIC) が、このリソースをパブリッシュしました。
キーワード
Samplingevent; metabarcoding; cavity; forest management; biodiversity; Quercus rotundifolia; Observation
連絡先
- 最初のデータ採集者 ●
- 連絡先
https://orcid.org/0000-0002-1463-8393
- 最初のデータ採集者
- 最初のデータ採集者 ●
- 連絡先
- 連絡先
地理的範囲
Cabañeros y Monfragüe National parks
| 座標（緯度経度） | 南 西 [-90, -180], 北 東 [90, 180] |
|---|
生物分類学的範囲
N/A
| Kingdom | Fungi |
|---|---|
| Phylum | Blastocladiomycota, Mucoromycota, Sanchytriomycota, Glomeromycota, Ascomycota, Basidiomycota, Chytridiomycota |
| Class | Rhizophydiomycetes, Wallemiomycetes, Tremellomycetes, Atractiellomycetes, Mortierellomycetes, Microbotryomycetes, Glomeromycetes, Malasseziomycetes, Dothideomycetes, Candelariomycetes, Eurotiomycetes, Lecanoromycetes, Chytridiomycetes, Exobasidiomycetes, Sordariomycetes, Saccharomycetes, Sanchytriomycetes, Mucoromycetes, Dacrymycetes, Arthoniomycetes, Agaricomycetes, Cystobasidiomycetes, Ustilaginomycetes, Taphrinomycetes, Pezizomycetes, Xylonomycetes, Leotiomycetes, Orbiliomycetes, Agaricostilbomycetes |
時間的範囲
| 開始日 / 終了日 | 2024-05-13 / 2024-05-16 |
|---|
プロジェクトデータ
説明がありません
| タイトル | Impacto global sobre la formación de cavidades y la diversidad oculta en Parques Mediterráneos |
|---|---|
| 識別子 | SPIP2023-029955 |
| ファンデイング | Ministerio para la Transicion Ecologica y el Reto Demografico. Organismo autonomo de Parques Nacionales |
プロジェクトに携わる要員:
収集方法
Metabarcoding of wood samples from tree cavities, extracted using an sterilized drill
| Study Extent | Cabañeros and Monfragüe National Parks. Selected old Quercus rotundifolia stands |
|---|
Method step description:
- Sampels were obtained using an sterilized drill. DNA was extracted from each sample using the DNeasy PowerSoil Pro kit (Qiagen). The fungal ITS2 region (~330 bp) was amplified using primers ITS3 and ITS4 in a two-step PCR protocol enabling sample multiplexing. Libraries were purified, quantified, pooled in equimolar amounts, and sequenced on a NovaSeq PE250 platform (Illumina), targeting ~4 Gb total output. Adapter removal and primer trimming were performed with Cutadapt. Sequence quality was assessed using FastQC and summarized with MultiQC (Ewels et al. 2016). Reads were quality filtered, denoised, merged, and chimera-checked using DADA2. Amplicon sequence variants were clustered into OTUs at 97 % similarity using DECIPHER to account for multiple ITS copies within fungal genomes as well as intraspecific sequence variation. Taxonomic assignment was performed against the UNITE database using the DADA2 classifier and independently validated using the GBIF Sequence ID tool with BLASTN searches. Final taxonomy was curated combining both approaches, field observations, and phylogenetic analyses.
追加のメタデータ
| 謝辞 | |
|---|---|
| 目的 | |
| メンテナンス内容 | Actualización de los datos o adición de algún campo si es necesario |
| 代替識別子 | 10.15470/krdxel |
| 0d2f3b66-8e5f-4632-8aa9-54fbfdd6d36b | |
| https://ipt.gbif.es/resource?r=cavdivfungi |