835d30de-f762-11e1-a439-00145eb45e9a doi:10.15468/l8vpay https://ipt.gbif.es/resource?r=collectionherbariumextremadura Herbarium of Vascular Plants Collection of the University of Extremadura (Spain) Tomás Rodríguez Riaño Área de Botánica, Facultad de Ciencias, Universidad de Extremadura Associated Party
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Trinidad Ruiz Téllez Área de Botánica, Facultad de Ciencias, Universidad de Extremadura Associated Party
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Francisco Javier Valtueña Sánchez Área de Botánica, Facultad de Ciencias, Universidad de Extremadura Associated Party
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Belén Núñez García Área de Botánica, Facultad de Ciencias, Universidad de Extremadura Associated Party
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2021-01-07 eng The herbarium of University of Extremadura (UNEX Herbarium) is formed by 38.341 specimens of vascular plants whose main origin is the autonomous region of Extremadura (Spain) and Portugal, although it also contains a smaller number of specimens from different places, including the rest of peninsular Spain, the Balearic Islands, the Macaronesian region (Canary Islands, Madeira and Azores), northwest of Africa (Morocco) and Brazil. Almost the 98% of the total records are georeferenced. It is an active collection in continuous growth. Its data can be accessed through the GBIF data portal at https://ipt.gbif.es/manage/resource?r=collectionherbariumextremadura In the paper Espinosa & López (2013) are described the specimens associated data set of the UNEX Herbarium, with the objective of disseminate the information contained in the data set for promote the multiple uses of it. Established in 1986, the specimens incorporated in the herbarium of vascular plants collection of University of Extremadura (UNEX Herbarium), are the result of the work of collection and identification by different researchers associated with the Botany Area (Department of Plant Biology, Ecology and Earth Sciences) of the University of Extremadura. Chief amongst these include: Professor Juan Antonio Devesa, founder and director of the herbarium until 2004; Trinidad Ruiz, curator and director since 2004 to 2020; Rafael Tormo, curator until 2019; Josefa López, curator and current director; Tomás Rodríguez, curator; Ana Ortega and Francisco Javier Valtueña. Other researchers who contributed to the growth of the UNEX Herbarium include, Mª Carmen Viera, Jacinto Pedro Carrasco, Adolfo Muñoz, Inmaculada Montero, and Francisco Mª Vázquez. In addition, the disinterested work developed throughout time by a lot of students of the University of Extremadura, especially, Mª Luisa Navarro Pérez. The development of different research projects has made it possible to improve the quality of the herbarium. Among them, the numerous compilations carried out by different members of the Botany Area in order to elaborate the first flora of the Extremadura region (Devesa, 1995) or the synthesis of different taxonomic families or genera for Flora Ibérica (http://www.floraiberica.org/). Additionally, 4.5% of the material comes from the purchase of part of the herbarium of Dr. J.V.C. Malato-Beliz. Limited and unpredictable funding has always been a challenge for ensuring sustained growth of the collection facility since its origin. Pteridophytes seed plants Extremadura herbarium collection Spain Portugal Baleares islands Macaronesian region Morocco Brazil Mediterranean area UNEX Herbarium. NA Occurrence GBIF Dataset Type Vocabulary: http://rs.gbif.org/vocabulary/gbif/dataset_type.xml This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License. https://colecciones.gbif.es/public/show/co107?lang=es According to the data collected in Espinosa & López (2013), specimens deposited in the UNEX Herbarium have been collected mainly from Iberian Peninsula (Spain and Portugal), northwest of Africa (Morocco) and Brazil. Maximum number of specimens included in the dataset are collected from Spain (31490) followed by Portugal (3488), Brazil (722) and Morocco (111) respectively. Regarding to Spanish provinces, Badajoz contributes 16910 specimens, followed by Cáceres (6855 specimens) and Cádiz (1012 specimens). Other sampling areas include Almería (711 specimens), Jaén (495 specimens), Málaga (411 specimens), Gerona (388 specimens), Huesca (371 specimens), León (308 specimens), Oviedo (293 specimens), Granada (290 specimens), Huelva (260 specimens) and Lérida (249 specimens). The specimens better represented in the database correspond to elements of the Mediterranean forest and/or scrubland. These specimens are developed under a seasonal climate of mild winters and hot and dry summers, with abundant rainfall in autumn and spring. Frequent in this climate are forest fires, to which the vegetation is adapted. Specimens from Brazil (except one specimen collected in the state of Santa Catarina), are collected in the state of Río Grande do Sul. This state has a humid subtropical climate and a hydrography classified into three major regions: Uruguay River Basin, Guaiba River, and Litoral. -115 65 52 -38 Majority of the specimens in UNEX Herbarium belong to class Magnoliopsida (27143 specimens) and Liliopsida (8508 specimens). These classes are followed by Filicopsida (505 specimens), Lycopsida (138 specimens), Coniferopsida (104 specimens), Equisetopsida (24 specimens), Ophioglossopsida (14 specimens), Gnetopsida (6 specimens), Taxopsida (4 specimens) Cycadopsida and Gingkgopsida (both with 2 specimens), and Psilotopsida (1 specimen). UNEX herbarium represents 210 families, of which 22% and 21% of the specimens belongs to Poaceae and Fabaceae family respectively. This is followed by Asteraceae (15%), Scrophulariaceae (6%), Lamiaceae (6%), Caryophyllacae (5%), Brassicaceae (4%), Cyperaceae (4%), Rubiaceae (3%), Ranunculaceae (3%), Liliaceae (3%), Boraginaceae (3%), Apiaceae (3%), and Cistaceae (2%). The herbarium includes 1253 genera (Figure 3), significant ones amongst them are Trifolium (1345 specimens), Ranunculus (623 specimens), Scrophularia (583 specimens), Vicia (537 specimens), Stipa(505 specimens), Galium (479 specimens), Juncus (439 specimens), Vulpia (381 specimens), Medicago (365 specimens) and Bromus (342 specimens) (Espinosa & López, 2013). family Acanthaceae family Aceraceae family Adiantaceae family Agavaceae family Aizoaceae family Alismataceae family Amaranthaceae family Amaryllidaceae family Anacardiaceae family Apiaceae family Apocynaceae family Aquifoliaceae family Araceae family Araliaceae family Araucariaceae family Arecaceae family Aristolochiaceae family Asclepiadaceae family Aspidiaceae family Aspleniaceae family Asteraceae family Athyriaceae family Azollaceae family Balanophoraceae family Balsaminaceae family Basellaceae family Begoniaceae family Berberidaceae family Betulaceae family Bignoniaceae family Blechnaceae family Boraginaceae family Brassicaceae family Buddlejaceae family Butomaceae family Buxaceae family Cactaceae family Callitrichaceae family Calycanthaceae family Calyceraceae family Campanulaceae family Cannabaceae family Cannaceae family Capparaceae family Caprifoliaceae family Caryophyllaceae family Casuarinaceae family Celastraceae family Ceratophyllaceae family Characeae family Chenopodiaceae family Cistaceae family Clethraceae family Clusiaceae family Cneoraceae family Commelinaceae family Convolvulaceae family Coriariaceae family Cornaceae family Crassulaceae family Cryptogrammaceae family Cucurbitaceae family Cunoniaceae family Cupressaceae family Cyathaceae family Cycadaceae family Cyperaceae family Davalliaceae family Dicksoniaceae family Dioscoreaceae family Dipsacaceae family Droseraceae family Ebenaceae family Elaeagnaceae family Elaphoglossaceae family Elatinaceae family Empetraceae family Ephedraceae family Equisetaceae family Ericaceae family Euphorbiaceae family Fabaceae family Fagaceae family Flacourtiaceae family Fontinalaceae family Frankeniaceae family Fumariaceae family Gentianaceae family Geraniaceae family Gesneriaceae family Ginkgoaceae family Globulariaceae family Grossulariaceae family Guttiferaceae family Haloragaceae family Hamamelidaceae family Hemionitidaceae family Hippocastanaceae family Hydrangeaceae family Hydrophyllaceae family Hymenophyllaceae family Hypolepidaceae family Iridaceae family Isoetaceae family Juglandaceae family Juncaceae family Juncaginaceae family Lamiaceae family Lauraceae family Lemnaceae family Lentibulariaceae family Liliaceae family Linaceae family Loranthaceae family Lycopodiaceae family Lythraceae family Magnoliaceae family Malpighiaceae family Malvaceae family Maranthaceae family Marsileaceae family Melastomataceae family Meliaceae family Melianthaceae family Mimosaceae family Molluginaceae family Monimiaceae family Moraceae family Myoporaceae family Myricaceae family Myrsinaceae family Myrtaceae family Najadaceae family Nyctaginaceae family Nymphaeaceae family Oleaceae family Onagraceae family Ophioglossaceae family Orchidaceae family Orobanchaceae family Osmundaceae family Oxalidaceae family Paeoniaceae family Papaveraceae family Passifloraceae family Phytolaccaceae family Pinaceae family Piperaceae family Pittosporaceae family Plantaginaceae family Platanaceae family Plumbaginaceae family Poaceae family Podocarpaceae family Polemoniaceae family Polygalaceae family Polygonaceae family Polypodiaceae family Pontederiaceae family Portulacaceae family Potamogetonaceae family Primulaceae family Proteaceae family Psilotaceae family Pteridaceae family Punicaceae family Pyrolaceae family Rafflesiaceae family Ranunculaceae family Resedaceae family Rhamnaceae family Rosaceae family Rubiaceae family Ruppiaceae family Rutaceae family Salicaceae family Santalaceae family Sapindaceae family Saxifragaceae family Scrophulariaceae family Selaginellaceae family Simaroubaceae family Sinopteridaceae family Solanaceae family Sparganiaceae family Sterculiaceae family Styracaceae family Symplocaceae family Tamaricaceae family Taxaceae Taxodiaceae family Theaceae family Theligonaceae family Thelypteridaceae family Thymelaeaceae family Tiliaceae family Tropaeolaceae family Typhaceae family Ulmaceae family Umbelliferaceae family Urticaceae family Valerianaceae family Verbenaceae family Violaceae family Vitaceae family Zannichelliaceae family Zingiberaceae family Zygophyllaceae kingdom Plantae phylum Pteridophyta phylum Spermatophyta class Magnoliopsida class Liliopsida class Filicopsida class Lycopsida class Coniferopsida class Equisetopsida class Ophioglossopsida class Gnetopsida class Taxopsida class Cycadopsida class Gingkgopsida class Psilotopsida daily Josefa López Martínez Área de Botánica, Facultad de Ciencias, Universidad de Extremadura Associated Party
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The following protocol is described in Espinosa & López (2013). Dried and pressed method has been adopted for preservation of the specimens deposited in the collection. After collection of specimens in the field they are pressed and dried with the aim of adapting them to a flat surface and remove water from the tissue, thereby preventing their degeneration or attacks by bacteria, fungi or insects that would destroy them. The dried material is mounted on a holder constituted by an A3 cardboard (42 × 29.7 cm) and a resistant paper (so-called jacket) dimension A2 (42 × 59.4 cm) that perfectly covers the cardboard, thus protecting the specimen. The assembly is made on the cardboard with transparent tape, allowing both that the specimen be tighten to the holder and that the assembly be aesthetic. After assembly, specimens are registered and labeled. Registration is done in a database (Microsoft Office Access Database → DarwinCore 1.2) in which each specimen is assigned a reference number allocated consecutively. The information contained in the record of each specimen is: institution owner of the herbarium, reference number, scientific name of the family and species, date of collection, georeferencing data (country, province, and town), habitat, Legitimavit, and Determinavit. All log data are printed and constitute the sheet label. Before putting the specimens in the herbarium they are stored in hermetic plastic boxes and kept for 48 hours in cold storage (freezers) at -40°C. In this way the material is decontaminated from possible attacks of pathogens that can destroy them and the rest of material wich is already in the herbarium. Finally, the specimens are kept inside compact enclosures in shelves where they are arranged taking into account the four main groups: pteridophytes, gymnosperms, monocotyledons and dicotiledons. Within each main group the specimens are alphabetical arranged by families and genera. Iberian Peninsula is the most significant geographic zone represented in UNEX Herbarium. Over 5000 specimens are collected from two provinces (Badajoz and Cáceres). Other two provinces, Cádiz and Almería, contributed specimens in the range of 500-1500. Out of the Iberian Peninsula, the specimens collected from Morocco (111 sheets) represent an area greater than 50% of the country. Conversely, specimens from Brazil (721 sheets) do not cover more than 3% of the area of the country (Espinosa & López, 2013). Taking into account that the specimens deposited in the UNEX Herbarium comes from diverse regions which is outcome of several research projects depositing the specimens, they are not collected using a single, uniform protocol. By one hand, regarding the materials from donations or purchases (e.g. herbarium of Dr. J.V.C. Malato-Beliz) the protocol followed for the collection of specimens is unknown. By the other hand, the methodology used in collecting plants by researchers from the Botany Area may change depending on the objectives pursued by the work they are carried out for (Espinosa & López, 2013). But in general, collection takes place following previous available references drawn from scientific works, herbarium material or indications from reliable collectors. Each specimen and associated data record was subjected to two quality procedures; (a) taxonomic determination or identification and (b) geo-referencing. For taxonomic identification, trusted experts were contacted, the 85% of the material has been identified by investigators of the Botany Area of the University of Extremadura. These experts have authored number of monographs, which include Vegetación y Flora de Extremadura (Devesa 1995) in which 2050 taxa’s were described (Espinosa & López, 2013). Other includes Las Gramíneas de Extremadura (Devesa, 1999) or the volumes of Flora iberica XV (Devesa et al., 2007) comprising the taxonomic synthesis of families Adoxaceae, Caprifoliaceae, Dipsacaceae, Rubiaceae and Valerianaceae, and XVI (under edition, see http://www.floraiberica.org/) in which these experts are responsible for the genera Arctium, Atractylis, Carlina, Crupina, Cynara, Echinops, Onopordum, Rhaponticum, Saussurea, Staehelina, and Xeranthemum. It is worth also to note the publications of new species of flora (Centaurea bethurica, Devesa and López 2008; Scrophularia fontqueri Ortega-Olivencia and Devesa 1998; Galiummoralesianum and G. talaveranum Ortega-Olivencia and Devesa 2003; Galium belizianum Ortega-Olivencia et al. 2004), whose typus are preserved in UNEX Herbarium. Besides the above mentioned authoritative literature, experts have also relied upon the biology of the reproduction of different taxa of the family Fabaceae (López et al. 1998, 1999a, 1999b, 2000, Ortega-Olivencia and Devesa 1997, Ortega-Olivencia et al. 1997, 2005, Rodríguez-Riaño et al. 1999a, 1999b, 1999c, 2004, 2006, Valtueña et al. 2007, 2008a, 2008b, 2010a, 2010b, 2011, 2012) or the genera Drosophyllum (Ortega-Olivencia et al. 1995, 1998) or Scrophularia (Ortega-Olivencia and Devesa 1993a, 1993b, Ortega-Olivencia et al. 2012, Valtueña et al. 2013). Use of these literature resources and long standing experience of the researchers, give a high degree of confidence to the taxonomic identification of the specimens (Espinosa & López, 2013). As the data say in Espinosa & López (2013), 98% of the records in the collection are georeferenced. A total of 58.38% have MGRS coordinates and the rest geographical coordinates. The MGRS coordinate system has been transformed into geographical coordinates through a geographic calculator (http://www.asturnatura.com/sinflac/calculadora-conversiones-coordenadas.php), while at the same time maintaining the MGRS coordinates in the database. The accuracy of these coordinates’ grids varies from 1 km2 to 10 km2. The geographical coordinates have been taken through the description of localities and search of these localities in Google Earth. The accuracy of geographic coordinate values also varies between 2 and 12 km depending on the number of decimal places contained. NA NA
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